Après la Seconde Guerre mondiale, de nombreux russophones d'Europe ont déménagé à Boston. Dans les années 1950, des émigrés locaux de l'Union soviétique ont décidé de construire une église orthodoxe. En 1953, ils ont trouvé une église protestante abandonnée, pour laquelle les propriétaires demandaient un acompte de 900 dollars, ce qui était une somme considérable à l'époque.

Les paroissiens ont aidé à collecter des fonds : chaque famille a fait un don de 30 dollars, bien qu'il n'y ait pas de riches parmi eux, même les médecins et les enseignants, pour survivre, étaient contraints de faire des travaux non qualifiés. Le bâtiment de l'église a été rapidement acquis, et toute la congrégation s'est mise au travail. D'abord, ils ont nettoyé et enlevé les déchets, puis ils se sont occupés de l'aménagement de l'autel et de la construction du iconostase. Un des paroissiens, un artisan du bois, avec des assistants, a fabriqué l'autel. Un autre, un invalide sans jambes, a réalisé en cuivre le premier chandelier, la table commémorative et a sculpté une croix pour l'Évangile. En mai 1955, bien que les travaux n'étaient pas encore terminés, l'église était déjà devenue un véritable temple orthodoxe et attirait des étudiants russes des universités de Boston.

L'ancien prêtre de l'église de l'Épiphanie, Roman Loukianov, se souvenait : "Avec le temps, ce quartier de Boston est devenu dangereux en raison de la montée de la criminalité. Les paroissiens avaient peur de venir aux services du soir, et le conseil de l'église a décidé de trouver un endroit plus calme pour le temple". En fin de compte, l'église a été déplacée dans un autre quartier.

Aujourd'hui, la congrégation compte plusieurs milliers de personnes. Ce sont à la fois les anciens émigrés de l'URSS, arrivés il y a plus de 30 ans, et leurs enfants, ainsi que de nouveaux émigrés récemment établis à Boston. Parmi les paroissiens, il y a beaucoup d'étudiants et de professeurs orthodoxes de l'Université Harvard, la plus ancienne des États-Unis. Il y a aussi des Américains qui ont adopté l'orthodoxie. "Nous devenons des émigrés dans notre propre patrie", disent-ils. Une école du dimanche fonctionne près du temple, où l'on étudie la langue russe.