Después de la Segunda Guerra Mundial, muchos rusohablantes de Europa se mudaron a Boston. En la década de 1950, los emigrantes locales de la Unión Soviética decidieron construir una iglesia ortodoxa. En 1953, encontraron una iglesia protestante vacía, por la que los propietarios pedían un anticipo de 900 dólares, que en ese entonces era una suma considerable.

Los feligreses ayudaron a reunir el dinero: cada familia donó 30 dólares, aunque entre ellos no había ricos; incluso los médicos y maestros, para sobrevivir, se vieron obligados a realizar trabajos no calificados. El edificio de la iglesia fue rápidamente adquirido, y toda la congregación se involucró en el trabajo. Primero limpiaron y sacaron la basura, luego se dedicaron a la construcción del altar y la creación del iconostasio. Uno de los feligreses, un maestro carpintero, junto con sus ayudantes, fabricó el altar. Otro, un discapacitado sin piernas, hizo de cobre el primer candelabro, la mesa conmemorativa y talló una cruz para el Evangelio. En mayo de 1955, aunque los trabajos aún no estaban terminados, la iglesia ya se había convertido en un verdadero templo ortodoxo y atraía a estudiantes rusos de las universidades de Boston.

El ex párroco de la iglesia de la Epifanía, Roman Lukyanov, recordó: "Con el tiempo, esta zona de Boston se volvió insegura debido al aumento de la criminalidad. Los feligreses temían asistir a los servicios vespertinos, y el consejo de la iglesia decidió encontrar un lugar más tranquilo para el templo". Como resultado, la iglesia fue trasladada a otro barrio.

Hoy en día, la congregación cuenta con varios miles de personas. Son tanto los antiguos emigrantes de la URSS que llegaron hace más de 30 años, como sus hijos, así como nuevos emigrantes que se han establecido recientemente en Boston. Entre los feligreses hay muchos estudiantes y profesores ortodoxos de la Universidad de Harvard, la más antigua de EE. UU. También hay estadounidenses que han adoptado la fe ortodoxa. "Nos estamos convirtiendo en emigrantes en nuestra propia patria", dicen ellos. En la iglesia funciona una escuela dominical donde se enseña el idioma ruso.