La rivière Smjadyn, se jetant dans le Dniepr, formait une baie propice à l'arrêt des navires, ce qui a joué un rôle important dans le développement de la région en tant que port occidental de Smolensk, tourné vers Kiev. En 1015, le prince Gleb y fut tué lorsque sa barque fut atteinte par des assassins envoyés par Sviatopolk. En 1019, ses restes furent transférés à Vyshgorod, près de Kiev. Probablement, peu après la canonisation de Boris et Gleb, un monastère fut fondé à l'embouchure de la Smjadyn en leur honneur. Cela s'est peut-être produit au début du XIIe siècle, lorsque Vladimir Monomaque posa la première pierre de la cathédrale de l'Assomption à Smolensk, et il était naturel de souligner le lien de la ville avec le culte des premiers saints russes par la fondation d'un monastère à l'endroit de la mort de Gleb. Le monastère était en bois et, probablement, fortifié au début du règne de Rostislav Mstislavich, de sorte qu'en 1138, il devint la base d'une opération politique : le prince Sviatoslav Olgovich, expulsé de Novgorod, y fut capturé et emprisonné.

La signification idéologique et politique du monastère fut soulignée par la construction d'un temple en pierre en 1145 par le prince Rostislav Mstislavich. La construction de la cathédrale se poursuivit probablement jusqu'en 1150. Il est remarquable que le monastère, éloigné de la ville, ait reçu un temple en pierre en même temps que l'achèvement de la cathédrale de l'Assomption. Cela pourrait être lié à l'influence du premier évêque de Smolensk, Manuel, qui cherchait à accroître l'importance ecclésiastique du diocèse à travers le culte des saints princes et le lieu de la mort de Gleb.

Les chroniques mentionnent qu'en 1197, le prince smolensk David Rostislavich fut enterré dans la cathédrale du monastère de Borisoglebsky. Cela permet de supposer que le temple avait été construit par Rostislav comme cathédrale pour la dynastie princière smolensk. Au XIXe siècle, l'historien S. P. Pissarev a suggéré que Smjadyn était une résidence princière fortifiée et un grand établissement commercial et artisanal, distinct de Smolensk.

Après le XIIe siècle, il n'y a pas de données directes sur la cathédrale de Borisoglebsky, seulement de rares mentions sur le sort du monastère. À la fin du XVIe siècle, les archimandrites Andreian et Théodose sont connus. En 1609, les troupes polonaises occupèrent le monastère, et en 1633, il fut remis à l'archevêque uniate Léon Krevza. En 1654, la région de Smjadyn était appelée « le désert de Zygimont ». Le temple de Boris et Gleb existait encore en 1680, mais était probablement déjà en ruines. I. I. Orlovsky a suggéré que les ruines commencèrent à être utilisées sous Pierre Ier, lorsque Smolensk fut fortifié. À la fin du XVIIIe siècle, le gouverneur général N. V. Repnin autorisa l'utilisation des pierres des ruines pour la construction. En 1825, P. P. Svinyin écrivait que les ruines étaient encore hautes. En 1833, le gouverneur N. I. Khmelnitsky ordonna d'utiliser des briques et des pierres des ruines pour la construction d'une route, mais les travaux furent rapidement interrompus. Malgré le pillage, les ruines permettaient de déterminer le plan du temple avec ses colonnes et ses absides.