Le monastère de Belo-Berezhskaya a été fondé en 1714 comme le Skit de Belo-Berezhsky dans la pittoresque région de Beloïe Berega, dans le district de Bryansk de la province d'Orel. Le fondateur était le moine Sérapion, sous le nom de Siméon (+1741). Le 9 février 1721, l'empereur Pierre Ier a émis un décret pour transformer le Skit en Pustyn, désignant le moine Sérapion comme constructeur et lui confiant la construction d'une église en bois en l'honneur de la Nativité de Saint Jean Baptiste. En 1755, une église en pierre à deux étages avec quatre autels au nom de la Sainte Trinité et des chapelles en l'honneur de l'icône de la Mère de Dieu de Vladimir, de Saint Nicolas le Miracleux et de la Nativité de Saint Jean Baptiste a été construite à la place de l'église en bois.

En 1777, la Pustyn a été abolie et rattachée au monastère de Bryansk de Pierre et Paul. En 1800, le vieillard Vassili (Kishkin, +1831), élève des anciens du Mont Athos et de Moldavie, est devenu le chef de la Pustyn, qui a ressuscité le monastère. En 1804, la Pustyn est redevenue un monastère autonome, et son supérieur a reçu le titre de constructeur. De 1804 à 1808, le monastère a été dirigé par le Vénérable Léon d'Optina. Entre 1847 et 1856, un clocher en pierre à cinq niveaux avec une horloge a été construit, et en 1878, une nouvelle cathédrale en pierre à cinq dômes a été consacrée en l'honneur de l'icône de la Mère de Dieu "Troïrouchitsa". Un Skit avec une église en bois a été aménagé près de la Pustyn. En 1916, le monastère comptait 9 églises et 32 bâtiments, y compris le bâtiment du supérieur, des dortoirs, des réfectoires, un hôpital, un bâtiment d'accueil, un foyer pour les pèlerins et divers ateliers, ainsi que des écuries et des étables. Au milieu du XIXe siècle, environ 200 personnes vivaient dans le monastère, et en 1916, environ 400.

La principale relique du monastère était l'icône de la Mère de Dieu "Troïrouchitsa", apportée à la Pustyn par le vieillard Sérapion le 12 juillet 1824, à partir de laquelle de nombreux miracles se produisaient. Pendant les jours de fête, le monastère accueillait jusqu'à cinq mille pèlerins. Le monastère était réputé pour son hospitalité et nourrissait gratuitement 300 à 400 nécessiteux pendant les années de famine. Il possédait également une grande bibliothèque et des archives. En 1918, la confiscation des biens du monastère a commencé. La communauté s'est unie en une commune de travail et a continué les services religieux. À partir de 1920, une colonie de travail pour enfants a été installée dans le monastère, et la communauté a été expulsée. À partir du 26 juillet 1924, les services religieux ont cessé. Tous les temples ont été détruits, et à la place de la cathédrale, un bâtiment de sanatorium pour enfants a été construit. De l'enceinte du monastère, seule une tour et un petit tronçon de mur ont été conservés, la plupart des bâtiments ayant été détruits.

Le 14 janvier 2004, le territoire du monastère avec ses constructions et ses communications a été transféré à l'Éparchie de Bryansk. Par décision du Saint-Synode de l'Église orthodoxe russe du 17 août 2004, le monastère masculin de la Pustyn de Belo-Berezhskaya en l'honneur de la Nativité de Saint Jean Baptiste a été rétabli, et l'hiéromoine Gleb (Shmatov) a été nommé supérieur. Actuellement, l'Éparchie de Bryansk effectue des travaux de réparation et de restauration sur le territoire de la Pustyn.