La comunidad de Belo-Berezhskaya fue fundada en 1714 como el Skit de Belo-Berezhsky en la pintoresca región de las orillas blancas del distrito de Bryansk de la provincia de Oryol. El fundador fue el monje Serapión, en la vestidura de Simeón (+1741). El 9 de febrero de 1721, el emperador Pedro I emitió un decreto para transformar el Skit en un Monasterio, nombrando al monje Serapión como constructor y encargándole la construcción de una iglesia de madera en honor al Nacimiento de San Juan Bautista. En 1755, se construyó una iglesia de piedra de dos pisos con cuatro altares en nombre de la Santa Trinidad Vivificante y capillas en honor a la imagen de la Madre de Dios de Vladimir, San Nicolás el Milagroso y el Nacimiento de San Juan Bautista.

En 1777, el Monasterio fue abolido y anexado al Monasterio de San Pedro y San Pablo de Bryansk. En 1800, el anciano Basilio (Kishkin, +1831), discípulo de los ancianos del Monte Athos y Moldavia, se convirtió en el jefe del Monasterio, quien lo revitalizó. En 1804, el Monasterio volvió a ser independiente, y su abad recibió el título de constructor. Desde 1804 hasta 1808, la comunidad fue dirigida por el Venerable León de Optina. Entre 1847 y 1856, se construyó un campanario de piedra de cinco niveles con un reloj, y en 1878 se consagró una nueva catedral de piedra de dos pisos con cinco cúpulas en honor a la imagen de la Madre de Dios 'Troeruchitsa'. Se estableció un Skit con una iglesia de madera. Para 1916, el monasterio contaba con 9 iglesias y 32 edificios, incluyendo el de la abadía, los de los hermanos, el comedor, el hospital, el de huéspedes, el de acogida y varios talleres, así como establos y corrales. A mediados del siglo XIX, alrededor de 200 personas vivían en la comunidad, y para 1916, aproximadamente 400.

La principal reliquia del monasterio era la imagen de la Madre de Dios 'Troeruchitsa', traída al Monasterio por el anciano Serapión el 12 de julio de 1824, de la cual ocurrieron numerosos milagros. En días festivos, hasta cinco mil peregrinos visitaban la comunidad. El monasterio era famoso por su hospitalidad y alimentaba gratuitamente a 300-400 necesitados en años de hambre. También contaba con una gran biblioteca y archivo. En 1918, comenzó la confiscación de los bienes de la comunidad. Los hermanos se unieron en una comuna de trabajo y continuaron con los servicios religiosos. Desde 1920, se estableció una colonia de trabajo infantil en el monasterio, y los hermanos fueron desalojados. Desde el 26 de julio de 1924, los servicios religiosos cesaron. Todas las iglesias fueron destruidas, y en el lugar de la iglesia catedral se construyó un edificio para un sanatorio infantil. Solo una torre y un pequeño tramo de la muralla del monasterio se conservaron, mientras que la mayor parte de los edificios fue destruida.

El 14 de enero de 2004, el territorio del monasterio con sus construcciones y comunicaciones fue transferido a la Diócesis de Bryansk. Por decisión del Santo Sínodo de la Iglesia Ortodoxa Rusa del 17 de agosto de 2004, el monasterio masculino de la desierto de Belo-Berezhskaya en honor al Nacimiento del Precursor y Bautista del Señor Juan fue reactivado, y el ieromonje Gleb (Shmatov) fue nombrado abad. Actualmente, la Diócesis de Bryansk está llevando a cabo trabajos de reparación y restauración en el territorio del Monasterio.