Le musée comprend quatre filiales : le musée « Maison Plotnikova », le musée « Domaine Khudyakova », le « Musée de Kuzma Minin » et le musée du verre « Cygne noir ». Trois d'entre eux sont situés dans le centre historique de Balakhna, à proximité les uns des autres. Ces musées sont issus du musée local de Balakhna, l'un des plus anciens de la région de Nizhny Novgorod, fondé en 1927. Ses collections contiennent environ 19 000 objets.

Chaque filiale a sa spécificité et ses axes de travail. Le musée « Maison Plotnikova » est dédié à l'histoire de la région depuis les temps anciens et comprend une salle d'exposition et un atelier de dentelle, un artisanat traditionnel de Balakhna depuis les XVIIIe-XIXe siècles. Le « Musée de Kuzma Minin », le seul en Russie, se trouve dans le centre culturel « Maison de Moscou » et a été construit en 2009 avec des fonds du gouvernement de Moscou en l'honneur de ce compatriote. L'exposition du musée est consacrée à Kuzma Minin, aux événements de l'époque troublée et à la création de l'armée populaire de Nizhny Novgorod.

Le domaine Khudyakova est un complexe avec un parc, où est présenté le mode de vie des marchands et des bourgeois, et où fonctionne un atelier de sifflets en argile. Le domaine se spécialise également dans l'organisation d'événements folkloriques.

Depuis le 20 août 2016, le village de Konevo dans le district de Balakhna abrite le seul musée du verre « Cygne noir » de la région de Nizhny Novgorod.