El museo incluye cuatro filiales: el museo "Casa de Plotnikov", el museo "Casa de Khudyakov", el "Museo de Kuzma Minin" y el museo de vidrio "Cisne Negro". Tres de ellos están ubicados en el centro histórico de Balakhna, cerca uno del otro. Estos museos surgieron del Museo de Historia Local de Balakhna, uno de los más antiguos en la región de Nizhni Nóvgorod, fundado en 1927. En sus fondos se conservan alrededor de 19 mil exposiciones.

Cada filial tiene su propia especialidad y áreas de trabajo. El museo "Casa de Plotnikov" está dedicado a la historia de la región desde tiempos antiguos e incluye una sala de exposiciones y un taller de encaje, una tradición de Balakhna desde los siglos XVIII-XIX. El "Museo de Kuzma Minin", el único en Rusia, se encuentra en el centro cultural "Casa de Moscú" y fue construido en 2009 con fondos del Gobierno de Moscú en honor a su compatriota. La exposición del museo está dedicada a Kuzma Minin, los eventos de la época de los Tumultos y la creación de la milicia de Nizhni Nóvgorod.

La Casa de Khudyakov es un complejo con un parque donde se muestra la vida de comerciantes y pequeños burgueses y funciona un taller de silbatos de cerámica. La casa también se especializa en la realización de eventos folclóricos.

Desde el 20 de agosto de 2016, en el asentamiento de Konevo, en el distrito de Balakhna, se ha abierto el único museo de vidrio en la región de Nizhni Nóvgorod, "Cisne Negro".