La fecha exacta y las circunstancias de la fundación siguen siendo desconocidas, sin embargo, las leyendas sitúan su aparición en el siglo XIII, posiblemente durante el reinado del príncipe Román de Uglich. Originalmente se encontraba a orillas del Volga, cerca de la desembocadura del arroyo Tróitski. Se menciona por primera vez en documentos de la segunda mitad del siglo XV, cuando el archimandrita Nafanaíl, contemporáneo del príncipe uglichense Andrés el Grande, estuvo presente en la consagración de la catedral de Pokrov en el monasterio uglichense homónimo en 1482. La archimandría se mantuvo en el monasterio hasta su cierre en 1764. Según el decreto del príncipe Dmitri Zhílka de 1509, se le otorgó al monasterio la aldea de Sintsovo con sus aldeas y la aldea de Olifnnikovo. En 1609, el monasterio fue capturado por los polacos, lo que resultó en la muerte del archimandrita Lavrenti, alrededor de 60 monjes y cerca de 500 defensores del monasterio.

Según las fuentes, en la década de 1670, en el territorio del monasterio solo había construcciones de madera, incluyendo la catedral de la Resurrección, la iglesia de la Virgen de Smolensk Odiquitri con el refectorio, la iglesia de la puerta de María Egipciaca, un campanario en forma de tienda, habitaciones residenciales y de servicio, así como una cerca. Entre 1674 y 1677, por orden del metropolitano de Rostov, Ionas Sysoevich, se construyó un conjunto de piedra del monasterio de la Resurrección en un nuevo lugar conocido como "Luzhitsy", que representa un destacado ejemplo de la arquitectura de Rostov de la segunda mitad del siglo XVII. El complejo consta de tres edificios dispuestos en línea y conectados por una galería. En el lado norte se encuentra la gran catedral de la Resurrección con dos capillas: la del norte en honor al Arcángel Miguel y la del sur en honor a Jacob. A continuación se encuentra el campanario de tres tramos con el altar de María Egipciaca. El conjunto se completa con el refectorio y la iglesia de la Virgen de Smolensk. Sobre el refectorio se alza una torre del reloj. Las paredes están decoradas con azulejos vidriados. Es posible que la construcción haya sido dirigida por el "oficial de piedra" I. Sakuyaín, y las pinturas fueron realizadas por iconógrafos de Kostroma bajo la dirección de Ionin, de las cuales solo se han conservado algunos pequeños fragmentos.

En 1764, el monasterio fue disuelto y transformado en una iglesia parroquial, cuyo abad fue el hieromonje Filofei. Los íconos, utensilios y objetos de la iglesia fueron transferidos al monasterio Alexeievsky de Uglich, y luego parcialmente devueltos para equipar la iglesia parroquial. El altar de María Egipciaca fue disuelto, y los nombres de las capillas de la catedral de la Resurrección fueron cambiados: la del norte se convirtió en honor a la Virgen de Vladimir, y la del sur, en honor a la Virgen de Znamenskaya. En 1777-1778, una comisión de la consistorio espiritual verificó el estado de los edificios de piedra y recomendó reparaciones urgentes. Las construcciones de madera también estaban en estado de emergencia. Desde la década de 1780, el refectorio albergaba una escuela espiritual del distrito. A principios del siglo XIX, comenzaron los trabajos de restauración, incluyendo la reparación del techo, el refuerzo de las paredes y bóvedas de la catedral, así como la restauración de la cerca. Para 1811, las puertas de ladrillo fueron completamente restauradas. Desde 1814, comenzó la restauración de la decoración pictórica en las capillas de Vladimir y Znamenskaya de la catedral. En 1851, el artista A.I. Nenastiev pintó la cúpula de la catedral de la Resurrección, y entre 1862 y 1865, D.G. Burenin volvió a pintar las paredes del templo. Fragmentos de las pinturas han sobrevivido hasta nuestros días. A pesar de los intensos trabajos a principios del siglo XX, el conjunto se encontraba en estado de emergencia debido a la debilidad del suelo.

En 1918, el monasterio fue transferido al Museo de Antigüedades de Uglich, donde se alojó temporalmente parte de la colección de arte antiguo ruso. En la década de 1920, los espacios subterráneos se utilizaron como almacenes. A mediados de la década de 1930, el monasterio cayó en la zona de construcción de la central hidroeléctrica de Uglich y se utilizó para las necesidades de "Volgostroy" del NKVD. En las décadas de 1950 a 1970, se llevó a cabo una restauración integral, incluyendo el refuerzo químico del suelo, lo que salvó el monumento de la destrucción. A finales de la década de 1980, comenzó la museificación del monasterio, pero se detuvo por falta de fondos.

En la primavera de 1999, gracias a los esfuerzos del difunto Arzobispo de Yaroslavl y Rostov, Mijaíl, el complejo de edificios fue entregado a la Iglesia Ortodoxa Rusa, y se reanudó la comunidad masculina. El primer abad fue el igumen, ahora archimandrita Víctor Zakharov. El 6 de junio de 2000 se celebró la primera Divina Liturgia, y el 18 de septiembre del mismo año, el obispo José consagró la iglesia de la imagen de la Virgen de Smolensk.