En agosto de 1990, el metropolitano de Volokolamsk y Yurievsky, Pitirim (Nechaev), bendijo el terreno para la construcción de un templo en honor a la Resurrección de Cristo en Yuzhno-Sajalinsk. La construcción avanzó lentamente. El proyecto de la catedral fue desarrollado por el arquitecto S. M. Michenko, inspirado en la arquitectura de Novgorod. La administración de la región y el alcalde de la ciudad, I. P. Farkhutdinov, brindaron un apoyo significativo en la construcción.

El 23 de febrero de 1993 se estableció la diócesis de Yuzhno-Sajalinsk y Kuriles, y el templo en construcción se convirtió en su catedral principal.

El 7 de enero de 1995, en la festividad de la Navidad de Cristo, se celebró el primer servicio en el nuevo templo, aunque los trabajos de decoración interior, acabado exterior y embellecimiento del territorio aún continuaban. La catedral de la Resurrección se convirtió en la primera iglesia ortodoxa completa en la región, ya que anteriormente las parroquias se ubicaban en edificios remodelados.

El 11 de septiembre de 2002 comenzó la construcción del campanario de la catedral, cuya bendición fue realizada por el obispo Daniil. La catedral renovada adquirió una nueva apariencia: se añadieron amplios coros para los cantores archidiocesanos, aumentó el área del comedor y del vestíbulo, y se construyó un campanario con una cúpula dorada. El 12 de octubre de 2003, tras la finalización de la construcción del campanario y la reconstrucción del edificio, se llevó a cabo la bendición del nuevo altar bajo la dirección del obispo de Yuzhno-Sajalinsk y Kuriles, Daniil. El servicio solemne con procesión, realizado ese día, fue el resultado de los primeros diez años de la diócesis.

El 20 de agosto de 2003, en un accidente aéreo, falleció el gobernador de la región de Sajalín, Igor Farkhutdinov, junto con otros catorce líderes de la región. Por iniciativa del obispo Daniil, se erigió un memorial junto a la catedral de la Resurrección con una cruz de veneración.

En 2005, en el territorio de la catedral, se instaló un hachkar armenio, realizado por maestros del valle de Ararat con toba armenia.

En 2007, comenzó la construcción de un centro de educación espiritual en el territorio de la catedral, donde se planificaron un auditorio, una escuela dominical, una biblioteca ortodoxa y otros espacios. La construcción finalizó en noviembre de 2009, y el 3 de marzo de 2010, el centro fue inaugurado.