La fundación del Museo Local de Surgut está relacionada con el nombre de Flegont Yakovlevich Pokazanyev, veterano de la Gran Guerra Patria, trabajador cultural merecedor de Rusia y ciudadano honorario de Surgut. Reunió cientos de exposiciones sobre la historia de la ciudad y la región, que se convirtieron en la base de la primera exposición del museo, inaugurada el 30 de noviembre de 1963 en una casa de madera de finales del siglo XIX, que pertenecía al comerciante surgutense Galaktion Stepanovich Klepikov.

Flegont Yakovlevich combinó durante mucho tiempo las funciones de director, conservador de fondos y guía. El 3 de enero de 1985, el museo se convirtió en una filial del museo regional de historia local, lo que permitió ampliar el personal y enriquecer los fondos. A principios de la década de 1990, el museo organizó la primera expedición etnográfica a los asentamientos de los jantys, lo que dio inicio al estudio de los territorios arqueológico-etnográficos del distrito de Surgut y al aumento de las colecciones. También comenzó la formación de colecciones de libros antiguos, íconos y hueso tallado.

En 1999, el museo se trasladó a un nuevo edificio en la calle 30 años de la Victoria, donde ocupa los dos primeros pisos. En 2002, fue uno de los primeros en la región en equipar los almacenes con equipos especializados para el almacenamiento de diversos objetos. En 2005, se inauguró en el primer piso un Centro Cultural y de Comunicación en estilo hi-tech, y el segundo piso está destinado a exposiciones temporales.

El 11 de junio de 2005 se inauguró la primera unidad estructural del museo, "La Casa del Comerciante" "Casa del comerciante G.S. Klepikov", el único monumento de historia y cultura de finales del siglo XIX en Surgut. Aquí se llevan a cabo diversos proyectos y eventos culturales. El 22 de junio de 2007, el Centro de Patrimonio Patriótico se incorporó a la estructura del museo, donde se realizan actividades de educación patriótica para la juventud, incluido el proyecto "Soldado de la Patria".

El 13 de septiembre de 2007, el museo inauguró el complejo memorial "Casa de F.K. Salmanov", dedicado al descubridor del petróleo siberiano. Aquí se recrea la atmósfera de los años 60, y el 11 de junio de 2009 se inauguró un busto de F. Salmanov. El museo continúa creciendo y desarrollándose junto con la ciudad, manteniéndose como su tarjeta de presentación.