Según la tradición local, registrada en varios manuscritos del monumento del siglo XVI "Relato sobre el establecimiento del cristianismo en Murom", la fundación del monasterio está relacionada con el príncipe muromiano Gleb Vladimirovich, no más tarde del año 1015.

Al recibir el control de Murom, el santo príncipe no pudo vivir en la ciudad debido a los paganos y fundó la corte principesca río arriba del Oka, en una empinada orilla boscosa. La aparición del monasterio a finales de los siglos X y XI se ha consolidado firmemente en la historiografía rusa, aunque existen otras opiniones sobre el momento de su fundación. El monasterio se menciona en las crónicas antes que todos los demás monasterios en el territorio de Rusia y figura en "Los relatos de los años pasados" bajo el año 1096 en relación con la "campaña muromiana" del príncipe de Chernigov Oleg Svyatoslavovich y la muerte bajo las murallas de Murom del príncipe Iziaslav Vladimirovich.

En el año 6604... Iziaslav reunió un ejército frente a la ciudad en el campo. Oleg marchó contra él con su ejército, y comenzó una feroz batalla. Iziaslav, hijo de Vladimir, nieto de Vsevolod, fue asesinado el 6 de septiembre... Oleg entró en la ciudad, y los ciudadanos lo aceptaron. Iziaslav fue enterrado en el monasterio de San Salvador.

A la muerte del príncipe muromiano Yuri Vladimirovich, el 19 de enero de 1175, se refiere la segunda mención del monasterio de Spas como lugar de su entierro: "el príncipe muromiano Yuri falleció el 19 de enero, y fue enterrado en San Salvador en Murom". Según el manuscrito Ipatiev, la iglesia donde fue enterrado el príncipe fue construida por su iniciativa: "en ese mismo año falleció el príncipe muromiano Yuri el 19 de enero y fue enterrado en la iglesia de Cristo en Murom, que él mismo fundó".

A finales del siglo XV, el monasterio de Spas se menciona en las crónicas en relación con la muerte del boyardo novgorodiano Fyodor Boretsky, quien tomó el monacato en el monasterio de Spas, la única comunidad masculina en Murom de esa época: "Esa misma primavera falleció en la ciudad de Murom el hijo de Marfa, Fyodor, y tomó el monacato el 9 de mayo".

A mediados del siglo XVI, tras la exitosa campaña de Iván IV el Terrible contra Kazán, se erigieron en Murom por orden del zar varias iglesias de piedra, incluyendo la catedral principal del monasterio de Spaso-Preobrazhensky.

A pesar de numerosas reconstrucciones, la catedral ha mantenido su aspecto original. Se siente la tradición de las catedrales de cinco cúpulas, que provienen de la catedral de la Asunción del Kremlin de Moscú. La ornamentación modesta, las proporciones estrictas y la monoliticidad del edificio le dan un aspecto de severa simplicidad, acorde con el solemne templo monástico.

El nombre del zar Iván el Terrible también está asociado con el inicio del florecimiento económico del monasterio de Spas. El zar dotó a la comunidad de amplias propiedades y estableció en ella "vida comunitaria". En los inventarios de Murom de 1624 y 1636, 1637, el monasterio figura como "edificio del estado", lo que confirma la activa participación de la familia real en la vida de la comunidad. En 1616, Murom fue atacado por un destacamento lituano bajo el mando del noble Alexander Lisovsky, durante el cual también sufrió el monasterio de Spas. Durante las reformas eclesiásticas del Patriarca Nikon, Murom resistió durante mucho tiempo a las innovaciones, y el monasterio de Spas se convirtió en un bastión del anticuado rito. El abad archimandrita Antonio escribió varios llamamientos sobre la disposición de los dedos y envió una petición al zar Alexei Mikhailovich señalando los errores en la corrección de libros bajo el Patriarca Nikon. En 1662, el archimandrita Antonio fue destituido de la administración del monasterio, y en febrero de 1666 fue convocado a un concilio en Moscú. A pesar de su arrepentimiento, fue exiliado al monasterio de Kirillo-Belozersky. En la década de 1680, el monasterio recibió grandes donaciones del metropolitano de Saransk y Podonsk, Varsanofio Chertkov, que provenía de la dinastía de comerciantes muromianos. Con sus fondos se construyeron en el monasterio un edificio de dos pisos para el abad y se inició la reconstrucción de la iglesia de la cena de la intercesión. En la década de 1720, el monasterio fue asignado a la Casa Arzobispal de Riazán, y en su territorio se abrió la primera escuela de la ciudad para la educación de los hijos de los sacerdotes.

El 26 de enero de 1765, se envió a la administración espiritual de Murom un decreto del obispo de Vladimir y Murom, Pavel Grebnevsky, sobre la disolución del monasterio de Borisoglebsky y la transferencia de la comunidad al monasterio de Spaso-Preobrazhensky. El venerable Serafín de Sarov visitó aquí al anciano Antonio Groshovnik. Desde 1866 hasta 1868, el monasterio fue administrado por el archimandrita Gabriel Voskresensky, profesor de la Universidad de Kazán y primer historiador ruso de la filosofía. En 1877, el abad se convirtió en el archimandrita Antonio Ilienov, quien encontró el monasterio en un estado deplorable. Después de un viaje en 1878 a Monte Athos, se trajo al monasterio una copia del ícono de la Madre de Dios "Súbito Auxilio". En la década de 1880, el monasterio fue restaurado y se convirtió en un lugar de peregrinación.

En 1891, se construyó en el territorio del monasterio un edificio de piedra de tres pisos para la comunidad, donde se alojaban los obispos vicarios de Murom. En 1907, se consagró en el edificio de celdas una iglesia doméstica en honor a los santos mártires de Quersoneso. Después de la revolución de 1917, el monasterio fue cerrado, acusando al abad, el obispo de Murom Mitrofán Zagorsky, de complicidad en la revuelta. En 1918-1919, la catedral de la Transfiguración continuó funcionando como iglesia parroquial. En la década de 1920, el monasterio fue ocupado por militares y el NKVD, y comenzó la destrucción del cementerio. En abril de 1990, la comunidad de Murom solicitó la transferencia del monasterio a la Iglesia Ortodoxa Rusa. En 1995, la unidad militar abandonó el monasterio, y comenzó su renacimiento. En 2000 y 2009, el monasterio fue restaurado a fondo con el apoyo de la Cámara de Cuentas de la Federación Rusa. El 22 de junio de 2005, se consagró en el territorio del monasterio una capilla en honor a San Jorge el Victorioso.