Inicialmente, el monasterio llevaba el nombre de Spaso-Peregrino, pero más tarde fue renombrado como Spaso-Evfimiev en honor al primer abad, el santo Evfimio de Suzdal.

Las construcciones de madera del monasterio no se han conservado, y su aspecto moderno se formó en los siglos XVI-XVII. La edificación de majestuosos edificios fue posible gracias a las generosas donaciones de la nobleza. Contribuciones significativas fueron hechas por el gran duque Basilio III, su hijo Iván, los príncipes Pozharsky y otros.

A las puertas del monasterio, el 7 de julio de 1445, tuvo lugar una batalla entre las tropas rusas bajo el mando de Basilio II y el ejército de Kazán liderado por los príncipes Mahmud y Yakub, hijos del kan Ulu-Mujammed. Basilio fue derrotado y capturado.

En 1511, el archimandrita del monasterio fue Kirill, quien más tarde se convirtió en arzobispo de Rostov, Yaroslavl y Belozersk.

El monasterio se menciona en la correspondencia de Iván el Terrible con Andrei Kurbsky, donde el príncipe emigrante señala que los monjes del monasterio Spas en Suzdal son conocidos por su avaricia y embriaguez.

El templo principal del monasterio, la catedral Spaso-Peregrino, está realizado en las tradiciones de la antigua arquitectura de piedra blanca de Suzdal, y se caracteriza por su monumentalidad y severidad. Las frescos del siglo XVI y las pinturas de los maestros Guriy Nikitin y Sila Savin tienen un valor especial.

En 1837, el heredero al trono Alejandro Nikolayevich visitó el monasterio, y el 16 de mayo de 1913, en honor al 300 aniversario de la dinastía Romanov, lo visitó el emperador Nicolás II con las grandes duquesas Olga, Tatiana, María y Anastasia.

En 1923 y 1939, en la antigua prisión del monasterio funcionó un aislamiento político, y desde 1935, una prisión de propósito especial. Aquí estuvieron detenidos, entre otros, el metropolitano Pedro de Krutitsy, el obispo Alejandro Boyarsky, los economistas Nikolai Kondratiev, Leonid Yurovsky, así como los activistas comunistas y del Komsomol Vladimir Nevsky, Martemyan Ryutin, Lazar Shatskin e Iván Smirnov.

En 1940, en el monasterio se encontraban los soldados internados de la Legión Checa del ejército polaco, liderados por Ludvik Svoboda, capturados tras la campaña polaca del Ejército Rojo. En 1941, con el inicio de la Gran Guerra Patria, se organizó aquí un campo de verificación y filtración para soldados y oficiales del Ejército Rojo que habían pasado por cautiverio o cerco. A través del campo pasaron 8232 personas. Desde el 1 de enero de 1943, el monasterio se convirtió en un campo para prisioneros de guerra, donde se mantenían oficiales y generales de la Wehrmacht, así como del ejército de Italia, Rumanía, Hungría y España, incluyendo al mariscal Friedrich Paulus.

Desde 1946 hasta 1967, en el territorio del monasterio funcionó una colonia de trabajo y educación para delincuentes juveniles: primero para niños, y después de la revuelta de 1947, para niñas. En 1968, el monasterio fue transformado en un museo.