El templo trinitario en la ciudad de Oboyan fue fundado en 1898, reemplazando a la iglesia de la Trinidad, construida en 1743. La construcción avanzó rápidamente, y los servicios comenzaron incluso antes de su finalización. El templo, finalmente erigido en 1908, se convirtió en el principal en Oboyan, uniendo las parroquias del templo trinitario y del templo anexo de Alexander Nevski, que permaneció como anexo hasta 1917. Alrededor del templo se encontraba el mercado central.

En 1917, la parroquia fue cerrada por decisión del Consejo de Diputados del Pueblo de Oboyan y se utilizó para otros fines. En la primavera y el verano de 1943, los servicios en el templo se reanudaron, y sus sótanos sirvieron como refugio contra los bombardeos aéreos alemanes.

El 22 de diciembre de 1990 se instalaron campanas en el templo. Desde 1990 hasta el 19 de agosto de 1993, el templo estuvo bajo el control de cismáticos, hasta que fue liberado por las fuerzas OMON.

En 2008 se celebró el centenario de la consagración del templo, y en 2009 comenzaron las obras de reparación interior.