En el siglo XVII, Noginsk era conocido como el pueblo de Yamskoe Rogozha, donde en el lugar de la actual catedral se encontraba el templo del santo Nicolás. En 1755 y 1767, en Rogozha, conocida como el Viejo Yamskoe Rogozhsky, los feligreses construyeron un templo de piedra en honor a la Epifanía del Señor con una capilla dedicada a Nicolás el Milagroso. En 1782, el pueblo se convirtió en ciudad y recibió el nombre de Bogorodsk.

En 1822 y 1824, se añadió al templo un refectorio con capillas en honor a la Protección de la Madre de Dios, en memoria de la liberación de la ciudad de los franceses en 1812, que coincidió con la festividad de la Protección, y del santo Nicolás. En ese momento, se construyó un campanario de dos niveles. En 1873, la iglesia se convirtió en catedral, que pronto fue desmantelada a petición de los feligreses y en 1876 se erigió un nuevo templo más espacioso en honor a la Santa Epifanía del Señor con las mismas capillas. En 1885 y 1886, el campanario fue elevado con un tercer nivel, y en 1890 se instaló una campana de 1250 puds, la más grande en las ciudades del distrito de Rusia, fundida con donaciones de los ciudadanos. En total, había 13 campanas.

La catedral poseía una capilla de piedra en el recinto de la iglesia con más de 90 íconos, una casa de piedra de dos pisos junto a la catedral, construida en 1834, una capilla de piedra en la plaza de la ciudad, erigida en memoria del salvamento de la familia imperial el 17 de octubre de 1888, una casa de piedra de dos pisos en la calle Shosseynaya con una tienda y un ala de madera, un edificio de madera de un piso en terrenos de la iglesia y una casa de guardia de madera, construida en 1896.

Desde 1895, el rector fue nombrado el futuro sacerdote mártir Constantín Bogorodski, el proto-presbítero Constantín Alexéyevich Golubiev. Sus reliquias fueron encontradas el 20 de noviembre de 1995 y ahora se encuentran en la iglesia de Tikhvin en Noginsk Bogorodsk.

Más tarde, el rector de la catedral fue el proto-presbítero Nicolás Alexandrovich Speranski, quien fue arrestado y exiliado en 1931, regresó del exilio a mediados de la década de 1930, pero en 1937 fue nuevamente arrestado y fusilado en Butovo. Un destino similar afectó a muchos clérigos y feligreses activos de la catedral. En un período difícil para la Iglesia, el rector fue el sacerdote mártir Serguéi Konstantinovich Makhaev, también fusilado en Butovo, y luego el sacerdote mártir Nicolás Alexandrovich Andreyev, fusilado el 10 de diciembre en Butovo.

La catedral fue cerrada en 1938, y desde 1940, en el edificio se instaló una producción de calzado relacionada con sustancias tóxicas y una estación de gas. En 1953, el ejecutivo de Noginsk intentó destruir las cúpulas y desmantelar el campanario, pero la catedral logró ser preservada.

En 1989, el templo fue devuelto a los creyentes. Un evento importante fue el servicio en las reliquias del venerable Serafín de Sarov en agosto de 1991. En 1993, la catedral fue ocupada por cismáticos, pero en noviembre de 1997 fue devuelta a la Iglesia Ortodoxa Rusa. El primer servicio en el templo recuperado se llevó a cabo el día de la aparición de las reliquias del sacerdote mártir Constantín el 20 de noviembre. Gradualmente, la vida parroquial se restauró, se realizaron trabajos de reparación y se instalaron nuevos iconostasios tallados con íconos pintados.

A la catedral se le asignaron capillas en honor a la icono de Tikhvin de la Madre de Dios en el territorio de la catedral, en memoria de los caídos en la Gran Guerra Patria en la Plaza de la Victoria y una capilla en el cementerio de la ciudad.