Im 17. Jahrhundert war Noginsk als das Jamskoe-Dorf Rogozha bekannt, wo an der Stelle der heutigen Kathedrale die Kirche des Heiligen Nikolaus stand. In den Jahren 1755 und 1767 bauten die Gemeindemitglieder in Rogozha, bekannt als Altes Rogozhsky Yam, eine steinerne Kirche zu Ehren der Epiphanie des Herrn mit einer Kapelle des Heiligen Nikolaus von Myra. Im Jahr 1782 wurde das Dorf zur Stadt und erhielt den Namen Bogorodsk.

In den Jahren 1822 und 1824 wurde der Kirche eine Sakristei mit Kapellen zu Ehren des Schutzes der Gottesmutter, zur Erinnerung an die Befreiung der Stadt von den Franzosen im Jahr 1812, die mit dem Fest des Schutzes zusammenfiel, und des Heiligen Nikolaus hinzugefügt. Gleichzeitig wurde ein zweigeschossiger Glockenturm errichtet. Im Jahr 1873 wurde die Kirche zur Kathedrale, die bald auf Wunsch der Gemeindemitglieder abgerissen wurde, und 1876 wurde eine neue, geräumigere Kirche zu Ehren der Heiligen Epiphanie des Herrn mit denselben Kapellen errichtet. In den Jahren 1885 und 1886 wurde der Glockenturm um eine dritte Etage erhöht, und im Jahr 1890 wurde eine Glocke mit einem Gewicht von 1250 Pud installiert, die größte in den Kreistädten Russlands, gegossen aus Spenden der Bürger. Insgesamt gab es 13 Glocken.

Zur Kathedrale gehörten eine steinerne Kapelle im Kirchenareal mit mehr als 90 Ikonen, ein steinernes zweigeschossiges Haus neben der Kathedrale, das 1834 erbaut wurde, eine steinerne Kapelle auf dem Stadtplatz, errichtet zur Erinnerung an die Rettung der kaiserlichen Familie am 17. Oktober 1888, ein steinernes zweigeschossiges Haus in der Shosseynaya-Straße mit einem Laden und einem hölzernen Anbau, ein einstöckiges hölzernes Gebäude auf dem Kirchengelände und ein hölzernes Wachhaus, das 1896 erbaut wurde.

Seit 1895 war der zukünftige heilige Märtyrer Konstantin Bogorodsky, Protopriester Konstantin Alexejewitsch Golubev, der Pfarrer. Seine Reliquien wurden am 20. November 1995 gefunden und befinden sich jetzt in der Tikhvin-Kirche von Noginsk Bogorodsk.

Später wurde Protopriester Nikolai Alexandrowitsch Speranski Pfarrer der Kathedrale, der 1931 verhaftet und ins Exil geschickt wurde, in den mittleren 1930er Jahren aus dem Exil zurückkehrte, aber 1937 erneut verhaftet und in Butowo erschossen wurde. Das gleiche Schicksal traf viele Kleriker und aktive Gemeindemitglieder der Kathedrale. In der schweren Zeit für die Kirche war der Pfarrer der heilige Märtyrer Sergij Konstantinowitsch Machaev, der ebenfalls in Butowo erschossen wurde, und dann der heilige Märtyrer Nikolai Alexandrowitsch Andrejew, der am 10. Dezember in Butowo erschossen wurde.

Die Kathedrale wurde 1938 geschlossen, und ab 1940 befand sich in dem Gebäude eine Stiefelreparaturwerkstatt, die mit giftigen Substanzen in Verbindung stand, sowie eine Gasstation. Im Jahr 1953 versuchte das Exekutivkomitee von Noginsk, die Kuppeln zu zerstören und den Glockenturm abzureißen, aber die Kathedrale konnte erhalten werden.

Im Jahr 1989 wurde die Kirche den Gläubigen zurückgegeben. Ein wichtiges Ereignis war der Gottesdienst an den Reliquien des heiligen Seraphim von Sarow im August 1991. Im Jahr 1993 wurde die Kathedrale von Schismatikern besetzt, aber im November 1997 wurde sie der Russischen Orthodoxen Kirche zurückgegeben. Der erste Gottesdienst in der zurückgegebenen Kirche fand am Tag der Auffindung der Reliquien des heiligen Märtyrers Konstantin am 20. November statt. Allmählich wurde das Gemeindeleben wiederhergestellt, Renovierungsarbeiten wurden durchgeführt und neue geschnitzte Ikonostasen mit gemalten Ikonen installiert.

Zur Kathedrale gehören Kapellen zu Ehren der Tikhvin-Ikone der Gottesmutter auf dem Gelände der Kathedrale, zur Erinnerung an die Gefallenen im Großen Vaterländischen Krieg auf dem Platz des Sieges und eine Kapelle auf dem städtischen Friedhof.