El Monasterio Masculino de San Panteleimon de Odesa fue fundado en 1995 con la bendición del Metropolitano de Odesa e Izmail, Agafangel, en el lugar de la antigua representación del monasterio ruso de San Panteleimon de Athos. Esta representación apareció en Odesa en 1876, lo que se confirma por publicaciones como la guía de E. Fesenko de 1883. El majestuoso templo de cinco cúpulas fue solemnemente consagrado el 28 de diciembre de 1895 por el Muy Reverendo Tikhon con la participación del ieromonje Pior y el clero diocesano. La piedra para la construcción del templo fue traída de la Santa Montaña de Athos.

Desde entonces, el monasterio se ha convertido en un lugar importante para los cristianos ortodoxos que buscan visitar la Santa Montaña de Athos y las antiguas reliquias de Palestina. Cada año, más de dos mil peregrinos partían de aquí en su viaje, recibiendo ayuda con el alojamiento, la alimentación y la tramitación de documentos. Después de la Revolución de Octubre de 1917, el monasterio, al igual que toda la Iglesia, atravesó tiempos difíciles. En 1923, el templo y la representación fueron cerrados.

El templo volvió a abrirse el 15 de junio de 1943 durante la Gran Guerra Patria con la bendición del Patriarca de Moscú y de toda Rusia, Alexis I. Aquí se abrieron cursos de Teología y Pastoral, que pronto se convirtieron en el Seminario Teológico de Odesa. En 1946-1947, aquí enseñó el igumen Pimen Izvekov, futuro Patriarca de Moscú y de toda Rusia. Entre los profesores estaban los futuros metropolitanos Serguéi Petrov y Leonti Gudimov. El seminario de Odesa fue graduado por destacados arciprestes como el metropolitano Vladimir y el metropolitano Agafangel, bajo cuyo liderazgo comenzó la resurrección del monasterio.

Sin embargo, el período de posguerra resultó ser breve. En 1961, durante el deshielo de Jruschov, el templo fue cerrado nuevamente y el seminario fue trasladado al Monasterio de la Asunción de Odesa. Los servicios en el templo se reanudaron en 1990, pero la verdadera resurrección de la comunidad comenzó con la llegada del metropolitano Agafangel. En 1995 se fundó aquí un monasterio masculino, y el 15 de agosto de ese mismo año se llevó a cabo la tonsura monástica. Comenzaron los trabajos para restaurar la vida monástica.

El 8 de diciembre de 1996, el metropolitano Agafangel consagró el altar principal del monasterio en honor a San Panteleimon y entregó a la comunidad parte de sus reliquias, traídas de Athos. Entre las reliquias del monasterio se venera especialmente la imagen de la Santísima Virgen "Digno es", que se renovó en tiempos difíciles y se convirtió en una aparición para los creyentes. Personas de todo el mundo vienen aquí para venerar las reliquias, disfrutar del silencio de la oración y fortalecer su fe.

En los últimos años, el monasterio se ha renovado significativamente. La fachada del templo fue adornada con íconos de mosaico, se restauró el campanario y se instalaron nuevas campanas. En el templo principal apareció un nuevo iconostasio en estilo bizantino, y las paredes fueron pintadas. Al subir por la escalera de mármol, se puede sentir la ascensión a la Santa Montaña de Athos. El monasterio se ha enriquecido con íconos que contienen partículas de las reliquias de los santos. La gracia de Dios permanece con la comunidad del monasterio, otorgándoles paz y alegría espiritual.