Das Odessaer Heilige Panteleimon Männerkloster wurde 1995 mit der Segnung des Metropoliten von Odessa und Ismail, Agafangel, an der Stelle des ehemaligen Vororts des russischen Heiligen Panteleimon Klosters vom Berg Athos gegründet. Dieses Vorort entstand 1876 in Odessa, was durch Veröffentlichungen wie den Reiseführer von E. Fesenko aus dem Jahr 1883 bestätigt wird. Die majestätische fünfkuppelige Kirche wurde am 28. Dezember 1895 feierlich von der Hochwürdigsten Tichon mit der Teilnahme von Hieromönch Pior und dem diözesanen Klerus geweiht. Der Stein für den Bau der Kirche wurde vom Heiligen Berg Athos gebracht.

Seitdem ist das Kloster ein wichtiger Ort für orthodoxe Christen geworden, die bestrebt sind, den Heiligen Berg Athos und die alten Heiligtümer Palästinas zu besuchen. Jährlich machten sich über zweitausend Pilger von hier aus auf den Weg und erhielten Hilfe bei der Unterbringung, Verpflegung und Dokumentenbeschaffung. Nach der Oktoberrevolution von 1917 erlebte das Kloster, wie die gesamte Kirche, schwierige Zeiten. 1923 wurde die Kirche und das Vorort geschlossen.

Die Kirche öffnete am 15. Juni 1943 während des Großen Vaterländischen Krieges mit der Segnung des Patriarchen von Moskau und ganz Russland, Alexius I, erneut ihre Türen. Hier wurden theologisch-pastorale Kurse eröffnet, die bald zur Odessaer Geistlichen Seminar wurden. In den Jahren 1946-1947 lehrte hier der Abt Pimen Izvekov, der zukünftige Patriarch von Moskau und ganz Russland. Zu den Lehrern gehörten die zukünftigen Metropoliten Sergej Petrow und Leontij Gudimow. Das Odessaer Seminar wurde von herausragenden Erzbischöfen wie Metropolit Wladimir und Metropolit Agafangel, unter dessen Leitung die Wiederbelebung des Klosters begann, abgeschlossen.

Der Nachkriegszeit war jedoch kurzlebig. 1961, während der Chruschtschow-Entspannung, wurde die Kirche erneut geschlossen und das Seminar in das Heilige-Uspenski-Kloster von Odessa verlegt. Die Gottesdienste in der Kirche wurden 1990 wieder aufgenommen, aber die eigentliche Wiederbelebung des Klosters begann mit dem Kommen von Metropolit Agafangel. 1995 wurde hier ein Männerkloster gegründet, und am 15. August desselben Jahres fand die Mönchsweihe statt. Die Arbeiten zur Wiederherstellung des klösterlichen Lebens begannen.

Am 8. Dezember 1996 weihte Metropolit Agafangel den Hauptaltar des Klosters zu Ehren des Heiligen Panteleimon und übergab der Abtei einen Teil seiner Reliquien, die vom Athos gebracht wurden. Unter den Heiligtümern des Klosters wird besonders das Bild der Heiligen Gottesmutter „Dostojno jest“ verehrt, das in schwierigen Zeiten erneuert wurde und für die Gläubigen ein Zeichen wurde. Menschen aus der ganzen Welt kommen hierher, um die Heiligtümer zu verehren, die Gebetsruhe zu genießen und ihren Glauben zu stärken.

In den letzten Jahren hat sich das Kloster erheblich erneuert. Die Fassade der Kirche wurde mit Mosaikikonen geschmückt, der Glockenturm wurde restauriert und neue Glocken wurden installiert. Im Haupttempel erschien ein neuer Ikonostase im byzantinischen Stil, und die Wände wurden bemalt. Wenn man die Marmortreppe hinaufsteigt, kann man das Gefühl des Aufstiegs zum Heiligen Berg Athos verspüren. Das Kloster wurde mit Ikonen mit Teilen der Reliquien der Heiligen bereichert. Gottes Gnade verweilt mit der Bruderschaft des Klosters und schenkt ihnen Frieden und geistige Freude.