El museo fue fundado el 12 de diciembre de 1886 como histórico-arqueológico bajo la Comisión Archivística Científica de Saratov. El inicio de su colección se dio gracias a donaciones de particulares y organizaciones. Para 1889, el museo ya contaba con 144 objetos.

Inicialmente, la colección se encontraba en el edificio donde también estaba la comisión archivística. En 1892, se trasladó al Museo Radischev. En 1893 se elaboró un nuevo catálogo, que incluía 1500 objetos.

En 1930, el museo se mudó a la mansión de M. A. Ustinov, construida en estilo neoclásico ruso en la década de 1810.

En los fondos del museo se conservan alrededor de 400 mil objetos, incluyendo colecciones arqueológicas, etnográficas, paleontológicas y entomológicas, así como ejemplares de libros manuscritos y de imprenta antigua, objetos de culto religioso, gráficos de carteles, numismática y materiales sobre la historia política, económica y cultural de la ciudad y la región.

Las colecciones del museo se enriquecen regularmente con exposiciones únicas. Por ejemplo, en junio de 2015, el museo recibió los diarios de N. I. Vavilov, y en diciembre de 2014, objetos relacionados con el arquitecto S. A. Kalistratov.