La iglesia de la Presentación de la Virgen María, también conocida como la iglesia de San Pedro y San Pablo, está situada en la alta y rocosa orilla izquierda del río Zusha, en el territorio del antiguo pequeño fuerte de la fortaleza de Mtsensk. En los siglos XVI y XVII, sirvió como iglesia catedral del monasterio masculino de San Pedro, que se consideraba uno de los más antiguos en la región de Orel. Según la tradición, el monasterio fue fundado en el siglo XII, sin embargo, es más probable que esto ocurriera a principios del siglo XVI, cuando Mtsensk se incorporó al estado de Moscú en 1500.

Según el libro de registros de la ciudad de Mtsensk de 1625, en el monasterio de San Pedro había dos iglesias de madera: la de San Pedro y San Pablo y la de la Presentación de la Virgen María con una capilla de San Elías el Profeta, renovadas con los fondos del primer zar de la dinastía Romanov, Mijaíl Fiódorovich. Junto a las iglesias se encontraban las celdas donde vivían el igumen y los monjes. En la década de 1670, el boyardo S. V. Ragozin construyó en el monasterio una iglesia catedral de piedra de siete cúpulas dedicada a la Presentación de la Virgen María con tres altares: el de la Presentación de la Virgen, el de los Santos Pedro y Pablo y el del Profeta Elías. Probablemente, en ese mismo tiempo se desmanteló la segunda iglesia de madera del monasterio. En 1694, el monasterio de San Pedro fue trasladado a un nuevo lugar más abajo en el río Zusha y pasó a llamarse monasterio de San Pedro y San Pablo, mientras que la iglesia de la Presentación se convirtió en parroquial. El campanario de la iglesia se construyó a finales de los siglos XVIII y XIX. Antes de la Primera Guerra Mundial, se planeaba establecer un skit junto a la iglesia de la Presentación, adscrito al monasterio de San Pedro y San Pablo, pero esto no se llevó a cabo.

La iglesia fue cerrada en la década de 1930, y durante la ocupación de Mtsensk, los alemanes la utilizaron como establo. Fue reabierta después de la Gran Guerra Patria en 1947. En el recinto de la iglesia se han conservado cuatro losas funerarias de piedra blanca de la primera mitad del siglo XVI y de mediados del siglo XVII, descubiertas por la historiadora del arte T. A. Timasheva. Una de las losas contiene la inscripción: "Año 7164 (1656) enero 18, falleció el siervo de Dios Iván Estefanovich Ragozin, en el monasterio como monje esquimático Iev".