En febrero de 1879, en Ekaterinodar, se completó la demolición de la catedral de la Resurrección, que había sido construida en 1802 con troncos de pino. Ya después de 30 años necesitaba una reparación seria. En la década de 1870 se requerían fondos significativos para su restauración, pero no se lograron conseguir. En 1878 se tomó la decisión de desmantelar el viejo templo. Los materiales restantes de la demolición, como troncos de pino, vigas y anclajes de hierro, se utilizaron para construir en el mismo lugar una pequeña iglesia de madera de la Resurrección, conocida como la iglesia de la Fortaleza. No duró mucho, y en mayo de 1887 se bendijo el lugar para un nuevo templo de piedra.

El proyecto de la iglesia de piedra fue probablemente desarrollado por el arquitecto militar N.G. Senyapkin, quien también dirigió su construcción. Al colocar los cimientos, se encontraron seis enterramientos, entre los cuales estaban las tumbas del ataman cosaco general mayor Z.A. Chepega y del ataman militar general mayor T.T. Kotlyarevsky, quienes a finales del siglo XVIII llevaron a los cosacos del Mar Negro a Kubán. También se encontraron las tumbas del coronel A.S. Vysotchin y del protodiácono militar R. Porokhni. Todos ellos fueron reenterrados bajo el refectorio del nuevo templo. El 30 de junio de 1892, en el centenario de la concesión de tierras a los cosacos del Mar Negro en Kubán por la emperatriz Catalina II, se bendijo la iglesia de piedra de la Resurrección.

La cerca de la iglesia de la Resurrección de Cristo se convirtió en lugar de enterramiento de conocidos habitantes de la ciudad. Sobre la tumba de uno de ellos, el ataman F.Y. Bursak, se instaló una capilla metálica diseñada por V.A. Filippov.

A principios de febrero de 1920, en la iglesia se celebró el funeral del comandante de caballería general mayor K.K. Mamontov, quien falleció de tifus en el hospital militar. Su entierro pasó desapercibido, el ataúd, acompañado por un pelotón de cadetes, fue llevado en fila por la calle Krasnaya hasta la catedral de Ekaterina (Roja), donde fue enterrado con salvas de fusilería.

El 9 de octubre de 1924, el presidium del comité ejecutivo del óblast de Kubán decidió cerrar la iglesia. En el verano de 1930, fue desmantelada y los ladrillos fueron vendidos.