Toda la belleza y el significado de la iglesia de Admiralteevo radican en su principal nave cuadrada, creada por arquitectos moscovitas. Las cinco cúpulas que adornan el templo son testimonio de la influencia de un nuevo estilo, traído a Moscú por Iván III. Una característica de esa época es la relación entre la estrecha anchura y longitud con una mayor altura, lo que simboliza el anhelo de la oración hacia los cielos. La nave de dos niveles con ventanas sostiene el techo, que pasa de cuatro pendientes a la bóveda del domo, lo que constituye una construcción única, ya que el techo no refleja las bóvedas del techo, como señaló el historiador Nikolai Vasilyevich Valukinsky.

El diseño arquitectónico del templo es típico de finales del siglo XVII y principios del XVIII. El cubo, de dos niveles y cúbico, tiene un plano cuadrado y está coronado por cinco cúpulas. El tambor central es luminoso y más grande que los de las esquinas, que no permiten la entrada de luz. Al este, el templo se adosa a un ábside de tres partes, igual en anchura al cubo, pero más bajo en altura. Los espacios internos del diácono y del altar constituyen la mitad del altar, aunque desde el exterior parece que todas las partes del ábside son iguales. La refectorio y el campanario, construidos posteriormente, están realizados en estilo neoclásico. En la pared sur del cubo hay dos placas, una de las cuales informa sobre la restauración de la iglesia para el 300 aniversario de la Armada Rusa en 1996. La otra placa, instalada en 2003, señala que aquí la Armada Rusa recibió la primera bendición antes de la campaña de Azov.

El techo está coronado por cinco cúpulas sobre pequeños tambores con cúpulas en forma de cebolla. Según Valukinsky, la decoración de los tambores recuerda a las iglesias moscovitas, pero no es una copia de ellas. El tambor central es luminoso, los demás no. La decoración del tambor central se remonta a las innovaciones de Alevis Nuevo. El cornisa bajo el techo se transforma en pilastras decoradas con cornisa, lo que le da al edificio un aspecto original. Los marcos de las ventanas están realizados en el estilo del siglo XVII, pero no hay frescos en la iglesia, y los restos de las antiguas pinturas están ocultos bajo el yeso.

A principios de la década de 2000, se instalaron en el templo paneles con fotografías que cuentan la historia de la iglesia. La esquina sureste de la refectorio es memorial, aquí se colocan placas en honor a los marineros que murieron en el 'Komosol'ts' y el 'Kursk', así como otros eventos conmemorativos. Se han instalado relieves de Pedro el Grande y almirantes, íconos y la bandera de San Andrés, que fue entregada a la iglesia en 2003 junto con el ícono de San Teodoro Ushakov.

Dentro del templo, es interesante el sistema de soporte de las bóvedas: los arcos se apoyan en dos pilares en el centro del cubo. Las bóvedas, excepto la central, son ciegas, y los tambores no son visibles desde el interior. La decoración de los pilares con elementos barrocos, probablemente, apareció más tarde. La altura del templo es de 13,1 metros, la del campanario, 21,4 metros. La pintura mural está enyesada, y la parcela de tierra bajo el templo ocupa 0,142 hectáreas.