Die gesamte Schönheit und Bedeutung der Admiralität Kirche liegt in ihrem Hauptquadratnave, der von Moskauer Architekten geschaffen wurde. Fünf Kuppeln, die den Tempel schmücken, zeugen von dem Einfluss eines neuen Stils, der von Iwan III. nach Moskau gebracht wurde. Ein charakteristisches Merkmal dieser Zeit ist das Verhältnis von schmaler Breite und Länge zu größerer Höhe, was das Streben des Gebets zum Himmel symbolisiert. Das zweigeschossige Schiff mit Fenstern stützt das Dach, das von vier geneigten Flächen in das kuppelartige Gewölbe übergeht, was eine einzigartige Konstruktion darstellt, da das Dach die Deckenbögen nicht widerspiegelt, wie Historiker Nikolai Wasiljewitsch Walukinski bemerkte.

Der architektonische Entwurf der Kirche ist typisch für das späte 17., frühe 18. Jahrhundert. Der Würfel, zweigeschossig und kubisch, hat einen quadratischen Grundriss und ist mit fünf Kuppeln gekrönt. Der zentrale Tambour ist lichtdurchlässig und größer als die Ecken, die kein Licht durchlassen. Im Osten schließt sich an die Kirche eine dreiteilige Apsis an, die in der Breite dem Würfel entspricht, aber niedriger ist. Die inneren Räume des Diakonats und des Altars machen die Hälfte des Altares aus, obwohl es von außen so aussieht, als wären alle Teile der Apsis gleich. Die Speisehalle und der Glockenturm, die später gebaut wurden, sind im klassizistischen Stil ausgeführt. An der Südwand des Würfels befinden sich zwei Tafeln, von denen eine über die Wiederherstellung der Kirche zum 300-jährigen Jubiläum der Russischen Marine im Jahr 1996 informiert. Die andere Tafel, die 2003 aufgestellt wurde, weist darauf hin, dass hier die russische Marine den ersten Segen vor dem Asowschen Feldzug erhielt.

Das Dach wird von fünf Kuppeln auf kleinen Tambours mit Zwiebelkuppeln gekrönt. Die Dekoration der Tambours erinnert laut Walukinski an Moskauer Kirchen, ist jedoch keine Kopie von ihnen. Der zentrale Tambour ist lichtdurchlässig, die anderen nicht. Die Dekoration des zentralen Tambours geht auf die Innovationen Alewisa Neuen zurück. Der Gesims unter dem Dach geht in Pilaster über, die mit Gesimsen verziert sind, was dem Gebäude ein originelles Aussehen verleiht. Die Fensterrahmen sind im Stil des 17. Jahrhunderts ausgeführt, aber es gibt keine Fresken in der Kirche, und die Reste früherer Malereien sind unter Putz verborgen.

Anfang der 2000er Jahre wurden im Tempel Stände mit Fotos aufgestellt, die die Geschichte der Kirche erzählen. Die südöstliche Ecke der Speisehalle ist ein Denkmal, hier befinden sich Tafeln zu Ehren der Seeleute, die auf der "Komsomolez" und "Kursk" gefallen sind, sowie anderer denkwürdiger Ereignisse. Es wurden Reliefs von Peter dem Großen und Admiralen, Ikonen und die Andreaskreuzflagge aufgestellt, die 2003 zusammen mit der Ikone des Heiligen Theodor Uschakow an die Kirche übergeben wurde.

Im Inneren der Kirche ist das Unterstützungssystem der Gewölbe interessant: Die Bögen ruhen auf zwei Säulen im Zentrum des Würfels. Die Gewölbe, außer dem zentralen, sind blind, und die Tambours sind von innen nicht sichtbar. Die Dekoration der Säulen mit barocken Elementen entstand wahrscheinlich später. Die Höhe der Kirche beträgt 13,1 Meter, die des Glockenturms 21,4 Meter. Die Wandmalerei ist verputzt, und das Grundstück unter der Kirche umfasst 0,142 Hektar.