A finales del siglo XVIII, en este lugar se encontraba la finca del capitán de estado P.N. Dmitrov, que más tarde pasó al príncipe A.N. Vyazemsky. En la década de 1840, la propiedad se dividió: una parte fue adquirida por la fábrica de azúcar Danilovsky y el restaurador I.Ya. Testov, y la otra fue comprada por el comerciante Yakov Yakovlevich Ermakov. Antiguo siervo de los condes Sheremetev, creó una producción textil en su aldea natal Mescheryno del distrito de Kolomna, que pronto se convirtió en la más grande de la región. En 1838, Ermakov se compró la libertad junto con su familia, se mudó a Moscú, se convirtió en comerciante y abrió una fábrica de estampado y tintura de telas detrás de la Puerta de Tres Montañas. Su hijo, Frol Yakovlevich, desarrolló el negocio de su padre, convirtiendo la firma 'Yakov Ermakov e hijos' en una de las más exitosas de Moscú.

Sin embargo, a principios de la década de 1880, la fábrica detrás de la Puerta de Tres Montañas fue cerrada. Las razones de esto son desconocidas, pero probablemente la muerte de seres queridos afectó a Frol Yakovlevich: su esposa María, sus hijos Andrey y Pavel, su hermano y su tío. En los últimos diez años de su vida, Ermakov se dedicó a la caridad. En el lugar de la fábrica, se construyó una casa de beneficencia para 500 personas con una iglesia, el edificio tenía forma de G con un campanario y una apsis altar. El templo de Filaret el Misericordioso y la casa de beneficencia fueron consagrados en 1889, más tarde se añadió una iglesia inferior en honor a la Dormición de la Justa Ana. La iglesia fue erigida en memoria del metropolitano de Moscú Filaret (Drozdev). Por orden de Frol Yakovlevich, se plantó un bosque cercano, llamado en su honor Bosque Ermakovsky, que ahora es recordado por la calle Bosque Ermakovsky.

La casa de beneficencia tenía una segunda sección en Sokolniki, diseñada para 500 personas. Ermakov también donó a otras instituciones benéficas de la provincia de Moscú, alimentaba a los pobres con comidas gratuitas, daba dinero a los necesitados y asignaba fondos para la construcción de iglesias y monasterios.

Alrededor de 1922, la iglesia doméstica de Filaret el Misericordioso fue cerrada y la casa de beneficencia fue liquidada. Parte del edificio de la casa de beneficencia Ermakov fue demolida, pero la iglesia de Filaret se conservó. Más tarde, en el lugar de la parte demolida y alrededor de la que quedó, se construyó un nuevo cuerpo infeccioso del DGBK № 9 en nombre de G.N. Speransky.

Por propuesta del Patriarca de Moscú y de toda Rusia Alexio II, comenzaron trabajos de restauración en la iglesia de Filaret. Según el proyecto de M.V. Isaev (CTRК 'Preeobrazhenskoye'), el edificio recuperó su aspecto histórico: se restauró la sala de dos alturas de la iglesia, dividida por arcos con el altar, el campanario con entrada desde el segundo piso y la escalera principal que une tres pisos. Los restauradores conservaron las bóvedas de Monye, prestando especial atención al acabado de las vigas metálicas.

En 2012, el objeto se convirtió en laureado del concurso del Gobierno de Moscú por el mejor proyecto en el ámbito de la conservación y promoción de objetos del patrimonio cultural 'Restauración de Moscú'.