La iglesia se menciona por primera vez en 1626 en los Libros de Posesiones de Kerekreyskiy V.A., donde se dice: «Iglesia de la Intercesión de la Santísima Virgen María, y en la iglesia imágenes, velas, libros, vestimentas, campanas y toda construcción eclesiástica». La última vez que se menciona la antigua iglesia de madera de la Intercesión en Belgorod es en 1787. En el registro clerical de 1870 se indica: «La iglesia de la Intercesión es de piedra con un campanario del mismo tipo, construida en 1791; se han añadido capillas: al lado sur en nombre del santo Mitrofán de Vorónezh en 1837, y al lado norte en nombre del santo Tikhón de Zadonsk en 1865, con fondos de los feligreses».

La iglesia se encuentra al norte de la catedral de la Asunción y San Nicolás en la calle Pushkin (anteriormente Batallón). En 1837 se añadieron nuevas capillas al frente sur, y en 1865 al frente norte, lo que le dio al edificio una forma cuadrada.

Es un interesante ejemplo de arquitectura de finales del siglo XVIII. En la composición volumétrica de la iglesia se destacan el cuarto de luz doble del templo con un techo cúbico y una cúpula en el pequeño cuarto, el campanario de cuatro niveles con niveles decrecientes, instalado sobre el vestíbulo, cerrado por adiciones tardías, y el ábside pentagonal de luz doble. Los centros de las capillas norte y sur están destacados por frontones triangulares y terminan con techos a dos aguas. En la plástica arquitectónica de las fachadas se nota una división estilística: el cuarto del templo y el ábside central están realizados en formas barrocas, mientras que el campanario es típico del temprano clasicismo. En las adiciones norte y sur predominan los elementos clasicistas de mediados del siglo XIX.

En la segunda mitad del siglo XX, el edificio de la iglesia se utilizó como talleres mecánicos. La restauración comenzó en 1991, y ya en 1993 se trasladó al templo el centro de la comunidad de Marfó-Mariinskaya desde el pueblo de Zimovénki.