Casa, construida para la familia del gobernador de Tomsk, Germán Augustovich Tobizen, fue la primera en recibir al heredero Nicolás, quien pasó allí solo un par de días. Los gobernadores que se sucedieron vivieron en esta casa menos de un cuarto de siglo. En los años de la revolución, el edificio se convirtió en símbolo de libertad y cuartel de los bolcheviques. Sin embargo, durante más tiempo, en la dirección ul. Sovietskaya, 45, estuvo la Casa de los Científicos, que hoy representa un pequeño pueblo con su teatro, sala de conferencias, consejo y biblioteca.

Desde su fundación, la provincia de Tomsk ha experimentado una falta de administradores experimentados, y todos los gobernadores de Tomsk llegaban de San Petersburgo o Moscú, sin quedarse mucho tiempo. Desde 1804 hasta 1889, el tesoro les proporcionaba alojamiento de alquiler. Solo a finales del siglo XIX se decidió construir una casa gubernamental municipal, que ahora es conocida como la Casa de los Científicos. Hasta ese momento, el estado alquilaba a los industriales del oro, los Korolev, una mansión en la calle Naberezhnaya del río Ushayka. Esta casa, desde la cual se podía ver los ríos y los prados de Tomsk, fue visitada por G.S. Batienkov y el explorador ártico barón Wrangel.

El primer gobernador para quien se construyó una casa especialmente en Tomsk fue Germán Augustovich Tobizen. Esto estuvo relacionado con la mudanza de la administración provincial a un nuevo edificio en la plaza Novo-Sobornaya y el desarrollo de universidades, lo que desplazó el centro cultural y comercial de la ciudad a esta área.

El gobierno de Tobizen coincidió con la visita a Tomsk del Gran Duque Nicolás, futuro emperador. Tobizen organizó todos los preparativos para su llegada, incluida la construcción de un pabellón en la entrada de la ciudad. Para la llegada de Nicolás II, se apresuraron a terminar la casa del gobernador, que se convirtió en su alojamiento temporal. El proyecto de la casa fue encargado a los arquitectos V.V. Jabarov y P.P. Naranovich. Jabarov, que llegó de Petersburgo, ya ocupaba el cargo de arquitecto provincial, mientras que Naranovich trabajaba en proyectos para la Universidad de Siberia.

A pesar de que dos arquitectos conocidos trabajaron en el proyecto, la construcción se retrasó, pero la llegada del heredero aceleró el proceso. Se asignaron fondos adicionales para preparar la casa para el alto huésped. Para la llegada de Nicolás II, las veinte habitaciones estaban decoradas y amuebladas. El heredero llegó a Tomsk el 5 de julio de 1891, pasó dos días en la ciudad, reuniéndose con el clero y funcionarios, y luego la abandonó.

Durante la Gran Revolución de Octubre, la casa del gobernador se convirtió en la Casa de la Libertad, donde se alojaron organizaciones revolucionarias. Aquí se llevaron a cabo reuniones de la fracción bolchevique y estudiantes, y se estableció el Consejo de Diputados de Trabajadores y Soldados. La casa se convirtió en cuartel de la Guardia Roja, y los blancos intentaron sin éxito capturarla. En el edificio también se encontraba la redacción del periódico "Estandarte Rojo".

Después de la revuelta contra Kolchak en diciembre de 1919, se izó una bandera roja en el edificio, y se convirtió en el lugar de alojamiento del consejo militar-revolucionario. En la década de 1920, la casa fue entregada a los científicos. Durante la Gran Guerra Patria, aquí se encontraba el cuartel de movilización de la ciencia y la técnica.

La Casa de los Científicos de Tomsk se convirtió en la tercera en Rusia después de Moscú y Petrogrado. Su fundador y primer director fue Nikolai Sigismundovich Poizner, y le ayudó la actriz Olga Pavlovna Boyarskaya. Desde 1995, la Casa de los Científicos es parte de la Universidad Estatal de Tomsk de Sistemas de Gestión y Radioelectrónica (TUSUR). En 2005 y 2006, con el apoyo de la administración de la región de Tomsk y TUSUR, se realizó una renovación capital en el edificio.