La iglesia fue construida entre 1785 y 1796 con fondos del comerciante de Arkhangelsk Lobanov, y la consagración del templo de Zacarías y Elisabet tuvo lugar en 1822. En 1855 y 1859, la iglesia fue ampliada, añadiendo galerías con dos capillas. Después del incendio de 1869, el edificio fue restaurado a su forma original en 1875.

Se ha conservado la parte oriental del nivel inferior del edificio de ladrillo con puertas de paso. El segundo nivel estaba ocupado por una pequeña iglesia de dos cúpulas sin columnas del tipo 'pequeño octógono sobre cuadrado'.

El tambor de luz con la cúpula sobre un cuello octogonal se apoyaba en la bóveda con pechinas en las esquinas. Las fachadas del cuadrado estaban rematadas con semicapillas de tres lóbulos, y las falsas lucernas en las aristas de la cúpula repetían su forma. La fachada exterior estaba decorada con elementos decorativos: marcos de formas complejas alrededor de las ventanas y paneles decorativos en las pilastras. El arco de la puerta estaba enmarcado por dos grandes volutas con un patrón entre ellas.

La iglesia está situada sobre la entrada oriental al complejo, cerrando la perspectiva de la calle Feferova. Se ha conservado parcialmente el nivel inferior, el arco de paso y parte de la fachada oriental con decoración, incluyendo volutas y marcos de ventanas. Basándose en materiales fotográficos de los fondos del Museo de Yeniséisk, se crearon bocetos de la reconstrucción de la fachada oriental en su forma original y con las galerías añadidas a mediados del siglo XIX.

En los niveles inferiores y en las tiendas simétricas había dos celdas, el archivo del monasterio, la administración y la biblioteca. Las entradas a estos espacios eran desde el paso, y a la iglesia se accedía por una escalera de madera desde el lado occidental. El cuadrado del volumen principal estaba cubierto por un alto tambor con ocho ventanas estrechas. Los nervios del tambor y los cuellos de las cúpulas de la iglesia y del altar se destacaban con volutas verticales.

En el siglo XIX, aparecieron lucernas decorativas en las aristas de la bóveda. El altar era de tres lados, y la cara oriental continuaba el plano de las fachadas del volumen inferior. Los techos de las tiendas eran de vigas, la base era de piedra, y las paredes de ladrillo no estaban enlucidas por fuera, sino que se blanqueaban con una fina capa.