A mediados de la década de 1780, la iglesia de madera de la Transfiguración, donde reposaban las sagradas reliquias del venerable Macario, se quemó. Los testigos afirmaron que sobre la tumba del anciano ocurrió un milagro: no quedó ni madera ardiente, ni brasas, ni siquiera cenizas, y el lugar estaba cubierto de un rocío inusual. En 1786, en el lugar de la iglesia quemada, se construyó un nuevo templo de madera en honor a la Transfiguración del Señor. A finales de la segunda década del siglo XIX, se construyó cerca una iglesia de piedra de la Transfiguración, uno de cuyos altares estaba dedicado a los venerables Macario de Pisem y Pablo de Obnorsk. La consagración de la nueva iglesia de cinco cúpulas en estilo clásico con un alto campanario de tres niveles tuvo lugar en 1821.

Después de los eventos de 1917, muchas iglesias de la tierra de Kostroma fueron destruidas, pero la historia del cementerio en Pisem se desarrolló favorablemente: su iglesia de piedra nunca fue cerrada, lo que se atribuye a la intercesión del venerable Macario. En 1929, comenzó la colectivización en el distrito de Bui, y las iglesias en los antiguos pueblos de la región de Pisem se cerraban una tras otra. Sin embargo, el cementerio, que se encontraba alejado de los asentamientos, permaneció intacto en los años treinta, aunque sufrió: de su campanario fueron arrojadas las campanas y se desmanteló la cerca de piedra con las puertas. A principios de los años cuarenta, este era el único lugar en la tierra de Kostroma donde las reliquias del santo se conservaban en una iglesia activa, accesibles para la veneración.

En los primeros años después de la guerra, la peregrinación a las reliquias continuó, pero en 1951, las autoridades decidieron poner fin a esto. A principios de agosto, antes de la festividad del trono del desierto de Macario, la Transfiguración del Señor, el comisionado del Consejo para los Asuntos de la Iglesia Ortodoxa Rusa en la región de Kostroma, M. Galkin, ordenó cerrar el acceso a las reliquias y al templo. El 8 de agosto, los trabajadores, bajo la dirección de Galkin, sellaron herméticamente las entradas al sótano y al templo.

A finales de 1993, por iniciativa del obispo de Kostroma y Galich, Alexander, la asamblea diocesana decidió revivir el monasterio. El 26 de febrero de 1994, el Patriarca de Moscú y de toda Rusia, Alexio II, bendijo la reanudación del monasterio de Macario-Pisem como un convento femenino. En el campanario de la iglesia de la Transfiguración se instalaron seis campanas, recolectadas de diferentes lugares o fundidas de nuevo, y ahora su sonido vuelve a resonar sobre el lugar sagrado del sacrificio del venerable.