In der Mitte der 80er Jahre des 18. Jahrhunderts brannte die hölzerne Erlöser-Verklärungskirche nieder, in der die heiligen Reliquien des heiligen Makariy ruhten. Zeugen berichteten, dass über dem Grab des Alten ein Wunder geschah: Es blieben weder brennendes Holz, noch Kohlen, noch sogar Asche zurück, sondern der Ort war mit einem ungewöhnlichen Tau bedeckt. 1786 wurde an der Stelle der abgebrannten Kirche eine neue hölzerne Kirche zu Ehren der Verklärung des Herrn errichtet. Ende der zweiten Dekade des 19. Jahrhunderts wurde in der Nähe eine steinerne Erlöser-Verklärungskirche erbaut, von denen einer der Seitenaltäre den heiligen Makariy von Pisemsk und dem heiligen Paul von Obnorsk gewidmet war. Die Weihe der neuen fünfkuppeligen Kirche im klassischen Stil mit einem hohen dreigeschossigen Glockenturm fand 1821 statt.

Nach den Ereignissen von 1917 wurden viele Kirchen im Gebiet Kostroma zerstört, aber die Geschichte des Friedhofs in Pisem war erfolgreich: Ihre steinerne Kirche wurde nie geschlossen, was man mit dem Gebetsschutz des heiligen Makariy in Verbindung bringt. 1929 begann im Bezirk Bui die Kollektivierung, und die Kirchen in den alten Dörfern der Pisem-Region wurden eine nach der anderen geschlossen. Der Friedhof, der weit entfernt von den Siedlungen lag, blieb in den dreißiger Jahren unberührt, obwohl er Schaden nahm: Von seinem Glockenturm wurden die Glocken abgeworfen und die steinerne Umfriedung mit Toren abgerissen. Zu Beginn der vierziger Jahre war dies der einzige Ort im Gebiet Kostroma, an dem die Reliquien des Heiligen in einer aktiven Kirche aufbewahrt wurden und für die Verehrung zugänglich waren.

In den ersten Jahren nach dem Krieg hielt die Pilgerfahrt zu den Reliquien an, aber 1951 beschlossen die Behörden, dem ein Ende zu setzen. Anfang August, vor dem Festtag der Makariy-Wüste, der Verklärung des Herrn, ordnete der Beauftragte des Rates für die Angelegenheiten der Russisch-Orthodoxen Kirche für die Region Kostroma, M. Galkin, an, den Zugang zu den Reliquien und zur Kirche zu schließen. Am 8. August nagelten Arbeiter auf Anweisung Galkins die Eingänge zur Krypta und zur Kirche hermetisch zu.

Ende 1993 beschloss auf Initiative des Bischofs von Kostroma und Galitsch, Alexander, die Diözesansynode, das Kloster wiederzubeleben. Am 26. Februar 1994 segnete der Patriarch von Moskau und ganz Russland, Alexius II., die Wiederbelebung des Makariowo-Pisemskij Klosters als Frauenkloster. Auf dem Glockenturm der Erlöser-Verklärungskirche wurden sechs Glocken installiert, die aus verschiedenen Orten gesammelt oder neu gegossen wurden, und nun ertönt ihr Klang wieder über dem heiligen Ort des Wirkens des heiligen.