La iglesia fue construida en 1794. Hasta su cierre a mediados de la década de 1950, la parroquia incluía 9 asentamientos: el pueblo de Prechistoe y las aldeas de Pokrov, Zaozerye, Yakovkovo, Bukovo, Starovo, Kilgino, Lyubil'tsevo e Itlar'. Los cambios en los límites del distrito de Rostov añadieron a la parroquia dos aldeas más, que anteriormente pertenecían al distrito de Pereslavl: Osteevo y Konyukovo. A 100 metros de la iglesia en el pueblo de Prechistoe se encuentra un antiguo cementerio. Según la leyenda local, mencionada por A.A. Titov en el libro "El distrito de Rostov de la provincia de Yaroslavl", en este lugar había dos iglesias de madera, destruidas por un incendio. La tercera iglesia de madera, desmantelada en 1794, supuestamente estaba en el lugar de la actual iglesia de piedra. Un nuevo cementerio se encuentra a 500 metros de la iglesia.

En 1962, en el pueblo de Prechistoe, el estudio de cine Gorky filmó la comedia atea "El fin del mundo", después de lo cual comenzó el saqueo y la destrucción de la iglesia.

En la pintoresca orilla del río Nerli, la iglesia de finales del siglo XVIII se estaba destruyendo gradualmente. Gracias a los esfuerzos de personas solidarias, este proceso se detuvo, y en octubre de 2011, el Metropolitano de Yaroslavl y Rostov, Panteleimon, nombró un rector para la iglesia. Hay mucho trabajo por delante: registro de la comunidad, acondicionamiento de parte de la iglesia para los servicios, numerosos trabajos de construcción y el renacimiento de la vida parroquial.