En los libros de ingresos de la diócesis de Riazán de 1676 se menciona una iglesia en el pueblo de Klin, dedicada a la Natividad de la Santísima Virgen. Junto a la iglesia había casas de los sacerdotes Iakov y Pavel, así como de los sacristanes y prosvirni. En la parroquia se contaban 5 casas de señores, de las cuales en una vivía un portero, 63 casas de campesinos y una de bobil. En el asentamiento de Kurmysh había 24 casas de campesinos y 2 de bobil. En el pueblo de Onferova había una casa de administradores, 18 casas de campesinos y 4 de bobil. En el pueblo de Fofanova se contaban 13 casas de campesinos. La tierra de la iglesia, obtenida de donaciones de boyardos, constituía 10 cuartas, y los prados de heno ocupaban un área de 20 copas.

No se sabe si la iglesia era de madera o de piedra, ya que los documentos de archivo sobre la construcción del templo de piedra no se han conservado. En 1812, el obispo de Vladimir, Ksenofont, emitió un decreto para la consagración de la iglesia, pero no queda claro si la iglesia fue construida de nuevo o simplemente renovada. Según las tradiciones locales, en ese momento se realizó una remodelación interna del templo y se construyó un nuevo campanario de piedra. Esto se confirma por el hecho de que el antimins en el altar de San Juan Evangelista, que es una adición más reciente, se utilizó en 1800. Probablemente, la iglesia de piedra en el pueblo de Klin fue construida en el siglo XVIII. En 1815, se organizó un altar en la iglesia en honor a la Madre de Dios de Todos los Que Lloran.

En 1864, aparecieron grietas en las paredes del templo, lo que requirió una reparación capital y un revestimiento de hierro. El campanario del templo se mantuvo firme, pero tenía una ligera inclinación. En el templo hay tres altares: el principal, dedicado a la Natividad de la Santísima Virgen, en el altar frío en honor al Evangelista Juan y en el altar cálido en nombre de la Madre de Dios de Todos los Que Lloran.

La iglesia estaba bien equipada con utensilios, vestimentas, íconos sagrados y libros de culto. Entre los objetos antiguos se conservó un Evangelio de altar de 1681, cubierto de terciopelo y adornado con plata y dorado. En sus páginas hay una inscripción: "Este santo Evangelio fue donado por Stefan Grigoriev hijo de Chirkov por su hermana Vassa y por Fedora y por Simeón, y fue construido de sus bienes en el distrito de Murom en nuestra antigua herencia en el pueblo de Klin para la iglesia de la Natividad de la Santísima Virgen en el año 1687".

A finales de la década de 1930, la iglesia fue cerrada. En el siglo XXI, el edificio de la iglesia en nombre de la Natividad de la Santísima Virgen está siendo sometido a una reparación capital gracias a la ayuda de benefactores.