El templo de la Transfiguración del Señor se encuentra al otro lado del río Sera, junto al monasterio de la Asunción en el área de Sadovni. El nombre de esta zona se remonta al siglo XVI, cuando se establecieron los jardines del Estado, y hasta hoy el lugar conserva abundancia de vegetación. En este sitio, la iglesia existió desde el siglo XVI y se llamaba templo de la Epifanía "que está en la corte del soberano", ya que se encontraba cerca de los palacios reales. El libro de registros de 1677 señala que en la nueva Sloboda de Alexandrov, bajo la ciudad, en la fortaleza Slobodka Mamonova, había una iglesia en honor a la Epifanía del Señor, construida de troncos.

El edificio de piedra de la actual iglesia de la Transfiguración fue erigido durante el reinado de Elizabeth Petrovna, quien vivió en la Sloboda de Alexandrov durante aproximadamente diez años y amaba mucho este lugar. Al convertirse en emperatriz, ordenó construir en 1742-1743, junto a la antigua iglesia de madera de la Epifanía, un templo de piedra en honor a los santos profeta Zacarías y la justa Elisabet, padres de Juan el Bautista. La santa justa Elisabet fue la patrona celestial de Elizabeth Petrovna.

En 1760, el viejo templo de la Epifanía fue reemplazado por uno nuevo de madera, y en 1790, al templo de piedra frío de los santos justos Zacarías y Elisabet se le añadió desde el sur un altar de piedra en honor a la Epifanía, en memoria de la antigua iglesia. Fue consagrado en 1795 por el abad Macario del desierto de Lukianov. A petición de los feligreses, el obispo de Suzdal y Vladimir, Víctor, bendijo renombrar el altar en el templo de Zacarías y Elisabet en memoria de la Transfiguración del Señor, y en el refectorio establecer un altar de los santos justos Zacarías y Elisabet. Este altar fue consagrado en 1804 por el hieromonje Nikon del desierto de Lukianov. El tercer altar fue consagrado en el refectorio a la derecha en honor a la Celebración de la Epifanía del Señor.

El campanario fue construido en 1804. La campana más grande pesa 237 puds y fue fundida en 1836 bajo el abad protodiácono Iosif Petrovich Klyuchev y el anciano de la iglesia Luka Andreyevich Uglkov.

En el pasado, la iglesia de la Transfiguración fue la única iglesia de piedra en la ciudad. Durante la época soviética, el templo fue cerrado, y en la década de 1930, su campanario y la cerca de piedra fueron destruidos. Milagrosamente, sobrevivió la cruz en el templo, cuya cima está adornada con una corona. La corona se colocaba en la cima de las cruces de los templos relacionados con personas coronadas, como señala el archimandrita Macario Mirólyubov. La corona en la cruz simboliza que la iglesia fue erigida por decreto real con fondos del tesoro real. Está coronada con la Cruz del Rey Celestial, recordando al Rey de la Gloria.

En el templo están enterrados los sacerdotes Iosif Petrovich y Petr Iosifovich Klyuchev, Petr Kalistov, el sacerdote de la catedral de la Natividad Nikolai Sergiev, la esposa del sacerdote del monasterio de la Asunción Sergiy Loginovich y la madre del metropolitano de Kiev Serapión.

En 2010, el templo fue devuelto a la iglesia. Inspirados por la fe y el deseo de renacer el templo, donde durante muchas décadas se celebró la Divina Liturgia, los creyentes se reunieron en una comunidad, que bajo la bendición del arzobispo de Vladimir y Suzdal, Evlogio, fue encabezada por el sacerdote Nikolai Korneev.

Desde la restauración de la comunidad el 3 de julio de 2012, comenzó el renacimiento de la vida espiritual parroquial y la restauración del templo. En el edificio medio en ruinas, en un pequeño rincón limpiado, comenzaron a realizarse moliebnos. Aunque el templo es un monumento de arquitectura de importancia federal, no recibe fondos para su restauración del presupuesto estatal y no tiene patrocinadores "de moda". Todos los fondos provienen de donaciones de feligreses y personas solidarias. Gracias a su apoyo, el templo se está restaurando metro a metro.