El pueblo de Milino alguna vez perteneció al príncipe Dmitri Pozharsky, quien liberó a Rusia de los invasores lituano-polacos. Comenzó la construcción de la iglesia en vida, pero se completó después de su muerte. Inicialmente, la iglesia tenía dos altares, con un altar lateral en honor al Arcángel Miguel, representado en el estandarte de la milicia del príncipe Pozharsky, con el cual liberó Moscú en 1612.

Después de que el concilio eclesiástico nikoniano prohibió en 1653 la construcción de iglesias con cúpulas, el deseo de erigir estructuras altas y inusuales, que se destacaran entre la construcción ordinaria y sirviesen como monumentos de su tiempo, se materializó en la creación de iglesias en varios niveles. Comenzaron a construirse masivamente a finales del siglo XVII, y muchos de estos hermosos monumentos de ladrillo y piedra se han conservado en los pueblos de la región de Moscú.

La iglesia en Milino, construida cien años después, demuestra la resistencia de las antiguas tradiciones, aunque en las capitales ya dominaba el clasicismo. El templo en Milino fue construido con dos octogonales sobre un cuadrado, con dos anexos bajos, un altar y una sala de comidas, formando un todo. A mediados del siglo XIX, con el fin de dar mayor importancia a la modesta iglesia rural, se modificó la composición del edificio: se amplió la sala de comidas y se añadió un campanario en el lado oeste. El campanario, con su macizo y tosco perfil, visualmente abrumó a la iglesia, que comenzó a parecer un apéndice de la alta torre de cuatro niveles. Probablemente, al mismo tiempo, de acuerdo con los nuevos gustos de las autoridades eclesiásticas, el edificio fue revestido con tablones, se añadieron columnas, pilastras y cornisas en estilo clásico, y los techos se cubrieron con hierro. Estos cambios privaron a la iglesia de madera de su calidez y lirismo originales.