La construcción del templo comenzó en 1620, justo después de las destructivas invasiones polaco-lituanas y suecas. La iglesia de Pedro y Pablo se convirtió en la primera de la escuela de iglesias de cúpula en la región de Prionezhie, y la iglesia de la Asunción en Kondopoga se considera la cúspide de este estilo arquitectónico. Las menciones más antiguas sobre la construcción de la iglesia en la isla Lychniy se encuentran en el Libro de Posesiones, elaborado por Andrey Plescheyev en 1583.

A lo largo de los años, la iglesia de Pedro y Pablo ha sufrido numerosos cambios. Por ejemplo, se eliminó la campanario de cúpula que estaba adyacente al refectorio por el lado oeste, se ampliaron las ventanas, se remodelaron ambas entradas y se aumentó la altura de la cúpula. Estos cambios se realizaron hace tiempo, pero incluso en el siglo XXI, la iglesia de Pedro y Pablo ha sido objeto de modificaciones. La empresa ZAO 'Lad', una organización de diseño, desarrolló un proyecto de restauración de la iglesia por iniciativa de la Agencia Federal de Cultura y Cinematografía, y los restauradores de la firma 'Exiton' literalmente dieron nueva vida al templo. Desde 2002 hasta 2004, se llevaron a cabo trabajos para reemplazar las vigas podridas en los lados sureste y norte del tronco. Los pisos del templo y del refectorio fueron nivelados, se reemplazaron varias vigas en el octógono de la iglesia, se restauraron la entrada y el techo, y se instaló una nueva cúpula. Como resultado de la restauración, la iglesia de Pedro y Pablo recuperó su aspecto histórico.

El estilo arquitectónico de la iglesia recuerda a la de Kondopoga, que también tiene un octógono situado sobre un cuadrado, siendo el nivel superior un poco más ancho que el inferior. También hay un friso frontal, pero en el templo de la isla Lychniy pasa sobre el cuadrado, aunque en elegancia y belleza es inferior al de Kondopoga. La iglesia de Pedro y Pablo se ve un poco baja y desproporcionada, ya que el altar es muy pequeño, mientras que la sala del refectorio parece masiva y amplia.

Uno de los detalles más bellos de la iglesia de Pedro y Pablo es el porche, que consta de tres partes: escaleras, plataforma inferior y superior. La plataforma superior se apoya en vigas de pared en forma de soporte. Los postes tallados sostienen el techo del porche y sirven como un marco decorativo característico del paisaje típico de Carelia, que se puede disfrutar desde la plataforma superior de las escaleras.

El interior de la iglesia difiere significativamente del de la iglesia de Kondopoga y se ve mucho más modesto. Las decoraciones interiores se han conservado mal, y algunos íconos están muy deteriorados.