En 1836, los habitantes del pueblo de Vilovatoye construyeron una iglesia de madera. El complejo eclesiástico también incluía una escuela parroquial y casas para el clero.

A finales del siglo XIX, la iglesia de madera se volvió demasiado pequeña. En 1900, los feligreses solicitaron permiso para construir una iglesia de piedra, diseñada para 1500 personas. La construcción comenzó ese mismo año con donaciones de los feligreses y fondos del comerciante de Buzuluk, Vasili Tikhonovich Prokhorov.

La edificación del templo de piedra continuó durante más de diez años y se completó en 1914. Seis años después, el templo fue cerrado, los clérigos fueron dispersados y se intentó volar el edificio.

En la década de 1930, activistas recolectaron firmas para cerrar la parroquia, y muchos aldeanos se vieron obligados a firmar la petición. El comerciante Prokhorov, que participó en la construcción del templo, fue arrestado y ejecutado. En 1944, según los recuerdos de un anciano, se intentó volar la iglesia para utilizar los ladrillos en la construcción de un aeródromo. Los militares dispararon con un cañón, destruyendo la cúpula, una pared del campanario, el bautisterio de invierno y la entrada al campanario. No se logró destruir completamente el templo. El edificio se utilizó como almacén de granos y estacionamiento para tractores. Los íconos fueron arrojados en el ábside norte, y la Sábana Santa y el Altar permanecieron sin ser limpiados incluso durante la llegada de granos. Las campanas fueron retiradas durante la guerra. En las festividades, los habitantes del pueblo acudían a la iglesia cerrada y cantaban oraciones.

Desde 1991, gracias al arzobispo Evsevi Savvin, se abrió la parroquia de San Miguel Arcángel en el pueblo de Vilovatoye. En 1993, los lugareños comenzaron a restaurar la iglesia, y se llevaron a cabo los primeros servicios en el templo.

En 2001, el obispo Sergiy bendijo al hierodiácono Alexey Medvedev para servir en el pueblo. Los primeros año y medio de servicio se llevaron a cabo casi sin feligreses. Ahora, el padre Alexey, que se ha convertido en ieromonje, continúa sirviendo en el templo. Gracias a sus esfuerzos y la ayuda de los lugareños, la iglesia ha comenzado a renacer: se instaló la cúpula central, se reparó el techo, se colocó el iconostasio, se reemplazaron las puertas y se blanquearon las paredes interiores. El número de feligreses ha aumentado significativamente, y ahora las personas vienen al templo no solo de Samara y la región, sino de toda Rusia.