Se han conservado pocos datos históricos sobre el templo. En el pasado, en el lugar de la aldea, en la orilla izquierda del río Peksha, se encontraba el cementerio de Arcángel con una iglesia en honor al Arcángel Miguel. A mediados del siglo XVIII, el cementerio desapareció y en su lugar surgió la aldea de Arjanino, también conocida como Arcángelka, que más tarde se fusionó con la aldea de Ankundinovo. En el mapa topográfico de la provincia de Vladimir, elaborado por Alexander Ivanovich Mende, quien entre 1849 y 1866 realizó trabajos topográficos y cartográficos en las provincias centrales del Imperio Ruso, se señala la aldea de Arcángel.

Hay una versión que dice que en 1867 el comerciante Grigori Belov construyó aquí una iglesia de piedra en honor al Arcángel Miguel, que fue anexada a la iglesia de la aldea de Aleksino. Los servicios religiosos eran realizados por los sacerdotes de la iglesia de Aleksino los domingos y en días festivos. Según otra versión, la iglesia fue construida con los fondos del terrateniente Mukhanov, cerca de su casa, pero las razones de la construcción siguen siendo desconocidas. Inicialmente, la iglesia era parroquial. El apellido Mukhanov todavía se encuentra entre los habitantes de las aldeas de Ankundinovo y Loginzevo, posiblemente son descendientes del supuesto constructor de la iglesia. La calle que adyacente a la iglesia todavía lleva el nombre de Arjaninskaya. A juzgar por la arquitectura simplificada en estilo clasicista y sus pequeñas dimensiones, los trabajos fueron realizados por los habitantes locales sin la participación de un arquitecto y trabajadores contratados, lo que también se confirma por la mampostería irregular de la iglesia. Al oeste, la sacristía anteriormente estaba adyacente a la campanario, que actualmente se ha perdido. Según los habitantes locales, fue destruido en la década de 1930 por orden de las autoridades soviéticas.

En la iglesia de la aldea de Ankundinovo funcionaba una escuela parroquial, donde el maestro era Pyotr Petrovich Kalliopin, quien se graduó del seminario espiritual de Vladimir en 1894.

Es interesante que en la aldea vecina de Loginzevo aproximadamente al mismo tiempo se construyó una capilla. Según Igor Sergeevich Golubev, originario de la aldea de Loginzevo, su bisabuelo Dmitry Yakovlevich participó en la construcción de la capilla. Es posible que la capilla y la iglesia de San Miguel en Arjanino-Ankundinovo fueran consagradas por los mismos sacerdotes.

En la época soviética, la casa del terrateniente se utilizó como refugio para niños sin hogar, y la iglesia fue convertida en comedor. Cuando la casa necesitó una reparación mayor, el refugio fue trasladado, y el comedor-iglesia en ruinas fue eventualmente convertido en un taller de clavos. En estado de abandono, el taller de clavos fue entregado a la Iglesia Ortodoxa Rusa. En la década de 1990, la comunidad de creyentes comenzó la restauración de la iglesia. Actualmente, la restauración continúa y los servicios religiosos se llevan a cabo regularmente.