La iglesia de la Epifanía en Goncharas se encuentra actualmente en el límite del centro histórico de Kolomna, lo que indica su ubicación anterior en las afueras, y aún antes, fuera de la ciudad. En tiempos antiguos, aquí había una aldea llamada Babyshevo, que pertenecía a la princesa Evdokiya, esposa de Dmitry Donskoy. Las primeras menciones de Babyshevo datan del siglo XIV. Tras la incorporación de Kolomna al principado de Moscú, el príncipe Ivan Kalita lo dejó en herencia a su esposa, lo que consolidó la tradición de transmitir la aldea a las esposas de los grandes príncipes. Durante la batalla de Kulikovo, Babyshevo pertenecía a la futura santa Eufrosinia, y luego a su nuera Sofía Vitovtovna y a su nieta María Yaroslavna. Sin embargo, en esos tiempos no existía iglesia en Babyshevo, al menos no se han conservado datos sobre ella. Probablemente, la primera iglesia fue construida por la siguiente propietaria de la aldea, Sofía Paleóloga, hija del último emperador bizantino y esposa de Iván III. Según la leyenda, ella no podía quedar embarazada durante mucho tiempo y oró en las iglesias de Kolomna y sus alrededores, incluyendo el monasterio de la Trinidad de San Sergio, donde se le apareció el santo Sergio. Poco después, dio a luz a un heredero, el futuro Vasily III. En honor a este evento y a los votos dados, Sofía Paleóloga ordenó construir en Babyshevo una iglesia de madera, consagrada en honor a la Concepción de Santa Ana. En el siglo XVI, Kolomna se expandió, y Babyshevo se convirtió en parte del barrio de Goncharna, donde vivían alfareros y fabricantes de ladrillos que construyeron las murallas del Kremlin de Kolomna por orden de Vasily III. Con la transformación de la aldea en barrio, se interrumpió la tradición de la propiedad principesca, y el lugar se convirtió en tierra diocesana. A finales del siglo XVI, la iglesia de madera se quemó, al igual que muchas otras construcciones de madera. Es posible que no fuera la iglesia construida por Sofía Paleóloga, sino su 'heredera', ya que el barrio de Goncharna ha ardido más de una vez. No se sabe cuántas veces la iglesia se quemó y fue restaurada, pero durante uno de los incendios ocurrió un milagro. El santo Filaret, nacido aquí, relató que en tiempos antiguos existía una iglesia de madera de la Concepción, que albergaba un ícono del Santo Rostro no hecho por manos humanas de la aldea de Mityaevo. Después del incendio que destruyó la iglesia, el ícono se conservó milagrosamente entre las cenizas. En memoria de este evento, en lugar de la iglesia quemada se construyó una nueva en honor al Santo Rostro del Señor, y la iglesia se hizo conocida como la iglesia de Spassky. En 1649, el barrio se incorporó oficialmente al asentamiento de Kolomna. La iglesia de la Epifanía se mantuvo como una de las pocas iglesias donde los servicios no se interrumpieron incluso en los tiempos más difíciles para la Iglesia y el país. Después de la Gran Guerra Patria, la iglesia recibió el estatus de catedral de la diócesis de Krutitsy y Kolomna, ya que la mayoría de las iglesias estaban cerradas para entonces. En esta tranquila zona de la ciudad de la región de Moscú, la vida de oración continuó, y los arzobispos de Moscú oficiaron aquí, en la iglesia que se convirtió en la patria espiritual de uno de los destacados líderes de la Iglesia Rusa.