An der östlichen Seite des Hauptplatzes des Klosters erhebt sich der massive Glockenturm, der über 32 Meter hoch ist. Sein Hauptteil, der in der zweiten Hälfte des 16. Jahrhunderts erbaut wurde, stellt eine mächtige Wand mit zwei niedrigen Bögen für die Glocken im zweiten Stockwerk und zwei breiten steinernen Zelten dar. Im Inneren des Glockenturms sind die Fundamente der Zelte jetzt nicht sichtbar, da sie an der Schnittstelle zwischen dem alten und dem moderneren Teil liegen. Im unteren Stockwerk des Glockenturms befand sich ursprünglich eine Kirche, die im Namen der Herkunft der Heiligen Kreuze des Herrn geweiht wurde und Mitte 1860 im Namen der Gottesmutter von Kiew umbenannt wurde. Ende des 17. Jahrhunderts wurde auf der Südseite eine Kapelle zu Ehren von Alexander von Swir gebaut. Zu Beginn des 19. Jahrhunderts erfuhr der Glockenturm erhebliche Veränderungen: In den Jahren 1808-1809 wurden die Zelte abgerissen und ein neuer Stock mit einer dreibogigen Arkade hinzugefügt. Das Projekt für den Anbau wurde von dem Kanzlisten des Erzbischöflichen Hauses, Mizerov, entworfen. Bis 1824 waren alle Arbeiten abgeschlossen, und es entstand eine Rotunde im klassischen Stil mit acht Säulen und einer Kuppel, entworfen von dem Architekten Pankov P. J. Die Uhr, die zuvor an den Heiligen Toren war, wurde auf den Glockenturm versetzt. Im Inneren des Glockenturms sind Fragmente von Malereien aus verschiedenen Epochen erhalten geblieben, die ältesten stammen aus dem späten 17. Jahrhundert und befinden sich in der Kapelle von Alexander von Swir. Der Tempel zeichnet sich durch Freskenikonen aus, die für Jaroslawl selten, aber in den Kirchen von Rostow verbreitet sind. Aufgrund der unregelmäßigen Heizung wurden die Malereien oft beschädigt und neu gemalt, im 19. Jahrhundert geschah dies viermal. Die oberen Stockwerke des Glockenturms wurden während des weißen Gardistenaufstands von 1918 stark beschädigt, aber in den 1920er und 1950er Jahren wurden Restaurierungsarbeiten durchgeführt, und der Glockenturm wurde wieder für die Stadtbewohner geöffnet. 1991 wurden die Glocken zurückgebracht, die lange Zeit getrennt waren. Die ursprünglichen Glocken sind nicht erhalten geblieben, daher wurden sie durch Exemplare aus den Beständen des Museums-Reservats ersetzt. Jetzt sind im Glockenturm achtzehn Glocken untergebracht, die im 16. und frühen 20. Jahrhundert in Petersburg, Jaroslawl, Holland und Pskow gegossen wurden. Die größte wiegt etwa 115 Pud. Der Glockenturm erfüllt wieder seine Funktion und hat den Status des ersten Glockenturms von Jaroslawl zurückgewonnen.

Die Kirche unter dem Glockenturm des Spaso-Preobraschenski-Klosters wurde ursprünglich im Namen der Herkunft der Heiligen Kreuze des Herrn geweiht. In den 1680er Jahren wurde sie unter dem Archimandriten Alimpij mit Malereien geschmückt, die im 19. Jahrhundert zweimal erneuert wurden. Einige Fragmente der Malerei aus dem 19. Jahrhundert sind an der östlichen Wand erhalten geblieben, die den hellen Raum des Tempels vom halbdunklen Altar trennt. An der Wand ist ein Ikonostas mit lokalen, festlichen, deesis und prophetischen Ebenen abgebildet. In der lokalen Ebene sind Darstellungen von Alexej dem Gottesmann, der Gottesmutter von Tichwin, der Kreuzigung und der Herkunft der Heiligen Kreuze zu sehen. Solche Malereien waren für die Kirchen von Rostow zur Zeit von Jona Sysojevich üblich, aber in Jaroslawl selten. Ähnliche Ikonostasen gab es auch in den jaroslawler Kirchen von Metropolit Peter und der Gottesmutter von Wladimir. An der Wand der südlichen Kapelle sind Nikolaus der Wundertäter, die Gottesmutter von Kiew, der Allmächtige auf dem Thron und die jaroslawler Fürsten Fjodor, David und Konstantin abgebildet, und in der zweiten Ebene, die Feste, in ovalen Medaillons, die Apostel mit Schriftrollen. In den Lunetten oben sind die Lobpreisung der Gottesmutter, die Königin des Himmels und das Zeichen abgebildet. 1824 wurde auf Anordnung des Erzbischofs Abraham in der Kirche ein bronzener Ikonostas installiert. 1860 wurde die Malerei auf Anordnung des Erzbischofs Nil neu gemalt, der den Tempel zu seiner Grabstätte machen wollte. Die Wände, mit Ausnahme der Altartrennwand, wurden neu verputzt und vom Künstler Jegor Konstantinowitsch Diakonow im akademischen Stil bemalt. An der Decke sind die neutestamentliche Dreifaltigkeit und sieben Engel mit Werkzeugen der Passion abgebildet, an den Wänden die Verklärung, der heilige Nil, der heilige Silvester und die jaroslawler Wundertäter. Nach Abschluss der Restaurierung am 30. Oktober 1860 wurde die Kirche von Erzbischof Nil im Namen der Gottesmutter von Kiew neu geweiht. In den 1970er Jahren wurde die Kirche von Kiew restauriert unter der Leitung von V.I. Wassin.