Die Geschichte des Uspenski-Klosters beginnt im Jahr 1552 mit dem Bau der hölzernen Uspenski-Kirche, die auf Befehl des Zaren an einem Tag an dem Ort seiner Residenz errichtet wurde. 1559 oder 1560 zerstörte die Überschwemmung des Flusses Kazanka diese Kirche und alle Gebäude des Klosters. Nach der Verlegung des Klosters auf den Zilantow-Hügel wurde ein neuer hölzerner Tempel ebenfalls der Himmelfahrt der Heiligen Gottesmutter geweiht. Die Geschichte des steinernen Zilantow-Klosters ist mit dem Bau der steinernen Uspenski-Kathedrale verbunden. Es gibt eine Legende, dass Iwan der Schreckliche anordnete, auf dem Zilantow-Hügel eine exakte Kopie der Dreifaltigkeitskathedrale der Dreifaltigkeits-Sergius-Lavra zu errichten, damit die Mönche das Leben der Bruderschaft der Lavra nachahmen konnten. Dies wurde unter Michail Fjodorowitsch vollzogen, und am 15. August 1625 wurde der neue steinerne Tempel von Metropolit Matthäus von Kasan geweiht. Zar Michail, der gottesfürchtig war, wurde zum Wohltäter des Klosters und spendete 1625 Ikonen und Ausstattung für die Uspenski-Kathedrale. Der Ikonostase der Kathedrale erinnerte an die der Lavra und wurde 1813 als alt und mit Farben und Gold verziert beschrieben. Der Tempel wurde 1729 erstmals renoviert, wahrscheinlich entstand damals auch die Galerie, die die Kathedrale mit der Allerheiligsten Kirche verband. 1835 wurde der Tempel erneut renoviert und am 15. August von Erzbischof Philaret von Kasan geweiht. Sein Aussehen hat sich kaum verändert, im Gegensatz zur umgebauten Allerheiligsten Kirche. 1895 wurde im Keller des Tempels eine Gruft zur Ruhestätte der Heiligen Apostelin Olga eingerichtet, finanziert von Olga Sergejewna Gejns. Die Bestattungen unter der Kathedrale gab es bereits früher, aber 1895 wurde dort ein unterirdischer Altar für die Seelenliturgien eingerichtet. Die Hauptheiligkeit des Tempels und des Klosters war das Ikone der Smolensker Gottesmutter, die als wundertätig verehrt wurde. Unter den Reliquien des Klosters wird 1909 auch die Ikone des Herrn Sabaoth aus alter Schrift erwähnt. Zu den Heiligkeiten des Tempels gehörte auch das Grab des Erzbischofs Joseph von Susdal, der 1640 ins Kloster kam, um Buße zu tun, und am 15. Juni 1642 starb. Das Grab befand sich am Eingang zur Kathedrale, und über ihm brannte eine Lampe zum Gedenken an den Heiligen.

In der Sowjetzeit wurde die Kathedrale zerstört, und fast alle ihre Heiligkeiten gingen verloren, einschließlich der Bestattungen des Heiligen Joseph und der in der Kapelle der Heiligen Olga Beigesetzten.

Heute steht an der Stelle der Uspenski-Kathedrale ein neuer Dreifaltigkeitstempel, der nach dem Entwurf der Dreifaltigkeitskathedrale der Dreifaltigkeits-Sergius-Lavra erbaut wurde, und die Allerheiligste Kirche wurde nach der Restaurierung im Jahr 2000 zur Himmelfahrt der Heiligen Gottesmutter geweiht.