In den frühen 1840er Jahren erwarb das Kloster das benachbarte Anwesen des Kaufmanns G.V. Butorin, wo sich zwei Häuser und ein prächtiger Obstgarten mit Apfel- und Birnbäumen befanden.

Am 19. Oktober 1843 begann der Bau der neuen warmen Epiphaniekathedrale auf diesem Gelände. Die Altäre ihrer drei Altäre wurden an den Orten platziert, wo zuvor Schwäne lebten. Der Bau der Kirche wurde zu einer echten Herausforderung für die Nonnen des Klosters. Die Gemeinschaft hatte nicht genügend Mittel für ein so großes Projekt, es gab keine großen Spenden oder Hilfe von außen. Daher sammelten viele Schwestern selbst Bruchsteine für das Fundament, gruben Ton, formten und brannten Ziegel, transportierten Baumaterialien und brannten Kalk. Unter ihnen war auch die zukünftige Äbtissin des Klosters, Izmaragda Woskresenskaja, damals Nonne Alewtina, die sieben Jahre in einem Ziegelwerk eine Werst von der Stadt entfernt verbrachte. Andere Nonnen sammelten Spenden, um Arbeiter zu engagieren. Mit der Zeit kamen Einlagen und Gaben.

Am 11. Juni 1844 begann der Mauerwerksbau der Kathedrale, und 1853 wurde der Bau abgeschlossen. Am 17. Oktober weihte Erzbischof Jewgenij den Hauptaltar und die rechte Kapelle zu Ehren des Tolga-Ikone der Gottesmutter, und am nächsten Tag, dem 18. Oktober, weihte der Archimandrit Nikodim die linke Kapelle zu Ehren des heiligen Nikolaus des Wundertäters und des heiligen Johannes des Barmherzigen, der später Bischof von Jenisseisk und Krasnojarsk wurde.

Die Kathedrale wurde nach dem Entwurf des berühmten russischen Architekten Konstantin Andrejewitsch Ton erbaut, der den Christus-Erlöser-Tempel in Moskau und viele andere Gebäude und Kirchen entworfen hat. Er beschäftigte sich auch mit der Restaurierung antiker Denkmäler und erstellte Alben mit typischen Projekten für Kirchen- und Zivilbauten.

Das Innere der Kirche ist ein geräumiger Saal mit vier Säulen, die die Gewölbe stützen. Die Altarapsiden befinden sich hinter einem zusätzlichen Paar Säulen, die die östliche Wand des Quaders ersetzen. Von Westen führt ein kleiner Vorraum in die Kirche, über dem sich im zweiten Stock eine Sakristei befindet, die über eine breite und bequeme innere Treppe zugänglich ist. Unter der Kathedrale befindet sich ein weitläufiger Keller, der hauptsächlich das Fundament des Gebäudes stärkt, aber auch für wirtschaftliche Zwecke genutzt werden kann. Unter der nördlichen Apsis der Kathedrale befand sich eine Kapelle mit dem verehrten Ikone der Gottesmutter "Wachendes Auge", deren Eingang von der Rostower Straße mit einem eisernen Vordach abgeschlossen war.

Die Kirche wurde mit Außenmalereien geschmückt. Über dem westlichen Eingang in einer halbrunden Nische befand sich ein Bild der Epiphanie des Herrn, das durch einen verglasten Rahmen geschützt war. Am 23. April 1888 wurden in den Nischen der Altäre Ikonen der Epiphanie des Herrn, der Erscheinung der Tolga-Ikone der Gottesmutter und des heiligen Nikolaus des Wundertäters, die auf Zinkblechen gefertigt waren, installiert. Im Jahr 1889 wurden auch in den Tympana der Kokoschki der Kirche Malereien auf Zinkblechen mit Darstellungen der Heiligen Dreifaltigkeit, der Geburt Christi, der Verklärung des Herrn, der Auferstehung und der Himmelfahrt des Herrn, der Erhöhung des Kreuzes des Herrn, der Verkündigung der Heiligen Gottesmutter sowie der Ikonen der Gottesmutter von Theodor und der Gottesmutter von Iweria angefertigt.

Die Ikonen in den Altar-Nischen gingen kurz nach der Schließung der Kirche verloren, und die Malereien der Kokoschki wurden stark beschädigt, die Zinkbleche verschwanden. Die Holzrahmen, an denen sie befestigt waren, wurden bei der Renovierung der Fassaden im Jahr 2006 abgenommen.

Im Jahr 2009 begann die Wiederbelebung der Kirche.