Die Saratower Gesellschaft der Naturforscher und Liebhaber der Naturwissenschaften wurde 1895 gegründet, und bereits ein Jahr später wurde das Museum dieser Gesellschaft eröffnet. In der Zeit von 1906 bis 1909 wurde, dank der finanziellen Unterstützung von V. F. Komar und den Spenden anderer aktiver Mitglieder der Organisation sowie mit Hilfe der Stadt, ein eigenes Gebäude nach dem Entwurf des Architekten V. K. Karpenko errichtet, der unentgeltlich arbeitete. Die Hauptspender des Museums waren die Mitglieder der Gesellschaft selbst, darunter bekannte Wissenschaftler und öffentliche Persönlichkeiten. Zum Beispiel übergab der Gründer des Chwalynsker Heimatmuseums, Michail Alexejewitsch Radischtschew, die ornithologische Sammlung an das Museum, und einen bedeutenden Beitrag zur Entwicklung des Museums leistete sein Leiter in den Jahren 1915 und 1921, der Botaniker Viktor Wiktorowitsch Fofanow.

In den ersten Jahren der sowjetischen Herrschaft verlor das Museum den Status einer selbständigen Einrichtung, und 1928 wurde seine Sammlung mit anderen im Heimatmuseum zusammengelegt, das jetzt Teil der Abteilung für Natur ist. Das elegante Gebäude des Museums und der Gesellschaft wurde in den 1960er Jahren abgerissen, und an seiner Stelle steht jetzt ein Wohnhaus.