Das Dorf Lobanowka, wie auch Istopki, Ropsk und Sachkowitschi, gilt laut dem Heiligen Filaret (Humiljewski), dem Erzbischof von Tschernihiw und Nischyn, als eine der ältesten Siedlungen des Neusybkowsker Kreises in der Tschernihiw-Region, die sich heute im Klimowski Bezirk der Region Brjansk befindet.

Die hölzerne Kirche im Namen der Heiligen Dreifaltigkeit in Lobanowka wird erstmals in Archivdokumenten aus dem Jahr 1793 erwähnt. Laut den Erzählungen der Einheimischen wurde im 19. Jahrhundert neben der Kirche ein gemauerter Glockenturm errichtet. Im Jahr 1856 wurde die Kirche renoviert. Am 4. März 1930 beschloss der Klimowski Bezirksausführungsrat die Schließung der Kirche, das genaue Datum ihrer Schließung ist jedoch unbekannt. Im Staatsarchiv der Region Brjansk wird das Protokoll der Sitzung des Klimowski RIK vom 4. März 1930 aufbewahrt, in dem das Gesuch des Lobanowski Gemeinderats über die Enteignung der Kirche und deren Übergabe an die Kolchose „Neues Leben“ zur Nutzung als Saatgutlager enthalten ist. Im Jahr 1937 wurde der Priester Panteleimon Ignatenko, der in Lobanowka lebte, verhaftet und erschossen. In den Jahren 1948-49 wurden die Kirche und der Glockenturm zerstört, und aus ihren Ziegeln wurde ein Dorfgemeinschaftshaus gebaut.

Im Jahr 1998 wurde in dem Dorf eine orthodoxe Gemeinde gegründet. Die lokale Verwaltung übergab der Gemeinde ein kleines Ziegelgebäude, in dem dank der Bemühungen des Priesters Alexander Markin eine Kirche eingerichtet wurde.

Im Herbst 2008 wurde Erdgas in die Kirche geleitet und eine Heizung installiert. Im Sommer 2009 wurde eine umfassende Renovierung im Inneren des Gebäudes durchgeführt, und an den Wänden wurden Ikonen in neuen Ikonenrahmen aufgehängt. Im Jahr 2011 wurde das Dach der Kirche vollständig ersetzt und ein metallisches Kreuz installiert.