Das Jenissei Iversky Damenkloster, ursprünglich bekannt als Iversky Frauenkloster, wurde 1623 gegründet, obwohl es auch andere Versionen gibt. Die Gründerin gilt als Paraskeva aus Nischni Nowgorod, aber auch hier gibt es unterschiedliche Meinungen. Ursprünglich war das Kloster der Geburt Christi gewidmet und wurde Christgeburt genannt, wie die hölzerne Kirche, die 1673 brannte. An ihrer Stelle wurde ein Jahr später ein neuer hölzerner Tempel zu Ehren der Wladimir Ikone der Gottesmutter erbaut. Brände beeinflussten mehrfach das Schicksal des Klosters.

Ende des 17. Jahrhunderts gab es in Jenisseisk viele Verbannte, und im Kloster wurde eine Abteilung mit Gittern zur Unterbringung wichtiger Verbrecherinnen eingerichtet. Hier befand sich Praskowja Saltykowa, die zukünftige Frau des Zaren Iwan Alexejewitsch, sowie die junge Maria Wolynskaja, die Tochter eines Höflings, die zur Nonne geweiht wurde, aber ein Jahr später zu ihrem früheren Status zurückkehrte.

Das Kloster war klein und bestand aus 7 Schwestern, einschließlich der Äbtissin: 4 Nonnen und 3 Nonnen. Die Schwestern versorgten das Kloster mit Gemüse und halfen Bedürftigen, was ihre karitative Tätigkeit ausmachte. 1758 wurde anstelle der alten Holzkirche die steinerne Christgeburt-Kirche mit zwei Etagen und sechs Seitenaltären eröffnet. Sie galt als die reichste in Sibirien, aber zwischen der Gemeinde und dem Kloster gab es Streitigkeiten, die durch den Brand von 1869 gelöst wurden, der sämtliches Eigentum zerstörte, außer zwei steinernen Gebäuden. Das Kloster wurde jedoch wiederhergestellt, und 1782 wurde eine neue Kirche zu Ehren der Iversky Ikone der Gottesmutter geweiht, nach der das Kloster Iversky genannt wurde.

1843, unter der Äbtissin Jewgenija, ließ sich der lokal verehrte heilige Alter Daniel von Achinsk im Kloster nieder, der hier begraben wurde, und über seinem Grab wurde eine steinerne Kapelle erbaut.

1865 wurde im Kloster eine Schule für Mädchen geistlichen Standes eröffnet.

Das Kloster blühte bis 1920, als die Nonnen, um es vor der sowjetischen Macht zu schützen, eine landwirtschaftliche Genossenschaft gründeten. Doch dies half nur kurz, und drei Jahre später wurde das Kloster geschlossen.

Die Wiederherstellung des Klosters begann 1998 unter der Leitung der Äbtissin Nonne Warwara. 2002 wurde die Auferstehungskirche wiederhergestellt, und in der Iversky Kirche wurden die Gottesdienste wieder aufgenommen.