Das Museum wurde am 5. Oktober 1919 auf Beschluss einer Kommission gegründet, die von dem bekannten Künstler und Akademiker der Malerei Fedor Alexandrowitsch Modorow, einem gebürtigen Mstjora, geleitet wurde, bei den staatlichen Kunst- und Handwerkswerkstätten von Mstjora.

Im April 1923 wurde das "Museum für kirchliche Altertümer" gegründet, das im Gebäude der Erscheinungskathedrale des ehemaligen Männerklosters von Erscheinung untergebracht war.

Im August 1945 wurde das Museum in das staatliche Mstjora-Museum für Volkskunst und Heimatkunde umgewandelt, das 1954 geschlossen wurde.

Von 1975 bis 1989 war das Museum eine Filiale des Staatlichen vereinigten Wladimir-Suzdal historischen, künstlerischen und architektonischen Museums-Reservats.