Die Kirche im Namen der heiligen Kosmas und Damian in Schebekino wurde zu Beginn der 2000er Jahre an der Stelle der zerstörten Kirche errichtet, die in der zweiten Hälfte des 18. Jahrhunderts existierte.

Die Geschichte der Logowski-Gemeinde reicht mehrere Jahrhunderte zurück. Die erste Holzkirche wurde 1764 erbaut und bestand 116 Jahre.

Im Jahr 1880, als die Holzkirche unbrauchbar wurde, wurde sie abgerissen und an derselben Stelle eine neue Steinkirche errichtet. Sie hatte eine Kuppel und einen Glockenturm, und rundherum befand sich der Dorffriedhof.

Mit dem Kommen der Sowjetmacht wurde die Kirche verwüstet und 1936 gesprengt. Aus den übrig gebliebenen Ziegeln wurden vier Wohnhäuser im Dorf des Logowski-Melzwerks gebaut. Der Friedhof wurde später abgerissen, und an der Stelle der zerstörten Kirche wurde eine Schule errichtet. 1943 wurde die Gemeinde wiederhergestellt. Mit den Mitteln der Gemeindemitglieder wurde ein Wohnhaus erworben, das in eine Kirche umgebaut wurde.

Am 14. Oktober 1990 legte der Pfarrer der Kirche, Protopresbyter Ioann Timofejev, den Grundstein für die neue Kirche. Die Weihe der neu erbauten Kirche wurde am 26. August 2006 von Erzbischof Ioann von Belgorod und Starooskol durchgeführt.