Die Kirche, die dem heiligen Apostel und Evangelisten Johannes dem Theologen gewidmet ist, ist eines der letzten Beispiele für Holzarchitektur in der Region Kursk. Sie befindet sich 16 km nördlich der Stadt Sudzha, im Verwaltungszentrum des Dorfes auf ebenem Gelände.

Historische Dokumente belegen, dass das Dorf Malaja Loknja an der Schwelle des 17. und 18. Jahrhunderts bereits eine etablierte Siedlung war. Dies lässt vermuten, dass es als Wachtpostensiedlung für Dienstleute, Kosaken und eine ganze Hundertschaft gegründet wurde. In der letzten Viertel des 18. Jahrhunderts gab es in Malaja Loknja bereits einen Holztempel zu Ehren des Theologen.

Bis zur Mitte des 19. Jahrhunderts war die alte Kirche baufällig geworden, und es wurde beschlossen, einen neuen Tempel zu errichten. Das bis heute erhaltene Holzgebäude der Theologenkirche wurde 1857 mit Mitteln der Gutsbesitzerinnen Alexandra Pawlowna Dawydowa und Anna Wassiljewna Durowa errichtet, die auf dem örtlichen Friedhof begraben sind.

Informationen aus den Kirchenakten von 1916 beschreiben den Tempel als Holzgebäude auf einem Steinfundament mit einem Glockenturm, das mit Eisen gedeckt war. In der Kirche gab es einen Altar zu Ehren des heiligen Johannes des Theologen. Das Landbesitz der Kirche umfasste Gutsland und Ackerland. Die Häuser für die Geistlichen befanden sich auf dem Kirchengelände, aber ihr Zustand war unterschiedlich: Das Haus des Priesters bedurfte einer Reparatur, während das Haus des Diakons in einem zufriedenstellenden Zustand war.

Die Gemeinde der Kirche umfasste zahlreiche umliegende Siedlungen, darunter Malaja Loknja, die Dörfer Kruglenkoje, Pogrebki, Alte und Neue Sorotschina, die Höhlen Nikolsky und Naidin, die Dörfer Nikolaevka, Novoivanovka, Lewshinka und das Dorf Staroje Gatische. Nach dem Verlust der Holzkapelle des Propheten Daniel im 19. Jahrhundert trat auch das Dorf Viktorovka in die Gemeinde ein.

In der Gemeinde gab es vier Volksschulen: in Malaja Loknja (gegründet 1875), im Dorf Kruglenkoje (1902), im Höhlen Nikolsky (1912) und im Dorf Neue Sorotschina (1915).

Im Jahr 1933 wurde die Kirche geschlossen und das Gebäude in einen Klub umgebaut. Die Etagen des Glockenturms, die Kuppel und der Achteck wurden abgenommen und ein Satteldach installiert.

Während des Zweiten Weltkriegs, in der Zeit der Besatzung, wurde die Kirche am 15. Juli 1942 wieder für Gottesdienste geöffnet. Der Kirchenrat wurde am 31. August 1944 registriert. Am 27. September 1950 wurde jedoch gemäß dem Beschluss des Oblastkomitees die Gemeinde der Gläubigen geschlossen und das Gebäude erneut dem Klub des Kolchos „Wostok“ übergeben.

In den 1990er Jahren war das Gebäude der Kirche in Malaja Loknja verlassen, aber im Frühling 2012 wurden die Gottesdienste im Tempel wieder aufgenommen.