Die Geschichte der Ust-Ishim-Kirche des Heiligen Nikolaus ist voller erstaunlicher Ereignisse. Vor vielen Jahrhunderten war das Gebiet von der Krushinka bis zur Irtysh und von der Ischim bis zum Gebäude der Verwaltung des Ust-Ishim-Distrikts eine alte Stadt, wo Ust-Ishim entstand. Die ersten Bewohner, die Tataren, wandten sich an den Generalgouverneur von Tobolsk mit der Bitte um Schutz vor Nomaden. Als Antwort wurde eine Gruppe Kosaken geschickt, die ein Jahr lang diente, aber mit der Zeit hier siedelten, Familien gründeten und Teil der lokalen Bevölkerung wurden.

Die erste Holzkirche wurde in der alten Stadt in der Nähe des Irtysh errichtet, brannte jedoch 1866 nieder. Zwei Jahre später stellte sich die Frage nach dem Bau einer neuen Kirche. Zu dieser Zeit erhöhte das Vorhandensein einer Kirche den Status des Ortes auf ein Dorf, wo eine Verwaltungsbehörde eingerichtet werden konnte. Es ging um die Wiederherstellung der Kirche in Ust-Ishim oder die Restaurierung in Slobodchiki, wo bereits die Kirche des Erzengels Michael stand. Die Ust-Ishim-Bewohner bestanden auf dem Bau bei ihnen, aber die Behörden neigten zu Slobodchiki.

Doch es geschah ein Wunder: Zwei Frauen fanden das Ikone des Heiligen Nikolaus an der Brandstelle. Diese Ikone, die von den Kosaken gebracht wurde, verbrannte nicht, was als Zeichen angesehen wurde. Infolgedessen wurde beschlossen, die Kirche in Ust-Ishim zu bauen. An der Stelle der Kirche wurde ein Denkmal für die Gründer der Stadt errichtet, das einen Marmorstein verwendete, der zuvor als Grabstein diente.

Die 1906 erbaute Kirche war die höchste in der Diözese der Region Tyumen, mit einer Höhe von 35 Metern. Sie war mit Malereien geschmückt und hatte eine einzigartige Architektur. In den sowjetischen Jahren wurden die Malereien unter Putz verborgen. Alteingesessene erinnern sich, dass die erste Holzkirche brannte und 1848 eine neue auf einem Steinfundament erbaut wurde, die ebenfalls durch ein Feuer beschädigt wurde. 1904 begann der Bau der Steinkirche, der 1906 abgeschlossen wurde.

Heute steht auf dem Gelände der Kirche ein hölzerner Glockenturm, der zum 100-jährigen Jubiläum der Kirche im Jahr 2004 erbaut wurde. Alteingesessene erinnern sich, wie sie in ihrer Kindheit Ziegel für den Bau brachten. In der Kirche gab es vier Öfen, deren Schornsteine durch die Wände führten und eine besondere Atmosphäre schufen.

In den Jahren des Bürgerkriegs und später erlebte die Kirche Verfolgung. 1932 führte ein Priester eine geheime Trauung durch, wofür er verhaftet wurde. Die Kirche wurde geschlossen und an eine Maschinen-Traktoren-Station übergeben, später als Lager genutzt. In den 50er Jahren versuchte man, hier ein Kino einzurichten, aber die Akustik erlaubte es nicht, und 1956 wurde der obere Teil der Kirche abgerissen.

1990 wurden die Gottesdienste nach der Weihe der Kirche mit einer kleinen Weihe wieder aufgenommen, aber vollständig wurde sie nie wiederhergestellt.