Die Kirche des Heiligen Nikolaus in Schebekino wurde in der Zeit von 2007 bis 2014 an der Stelle einer Kirche aus dem frühen 18. Jahrhundert erbaut, die nach der Revolution zerstört wurde.

Am Rande von Schebekino befand sich das alte Dorf Ustinka, in dem sich ein Kloster, die Korenskaja Nikolaevskaja Männliche Wüste, befand. Es erhielt seinen Namen zu Ehren des Heiligen Nikolaus des Wundertäters und des Flusses Koren. Ursprünglich war dies ein Rückzugsort für zwei Eremiten, Jona und Pimen, im Korenen Wald. Viele, die um Rat kamen, blieben hier, und so entstand die Wüste.

Der Hauptgeistliche Schatz war das wundertätige Ikone des Heiligen Nikolaus des Kriegers. Das Wunder von diesem Ikon geschah am 18. Mai im 16.-17. Jahrhundert (das genaue Jahr ist unbekannt). Die Bewohner von Ustinka und die Mönche der Wüste erschreckten die Tataren aus dem Wilden Feld: „Die Priester und Mönche, die am rechten Ufer des Flusses standen, riefen den Tataren zu: ‚Kehrt um; durch die Kraft des Kreuzes des Herrn wird der Heilige Nikolaus euch in diesem Fluss ertränken.‘ Wegen der Enge fielen einige Tataren in den Fluss, und die Horde, erschrocken, zog sich zurück.“ Das Ikone wurde sehr verehrt, und am 5. Juli 1765 beschloss die Belogorodische Geistliche Konsistenz: „Wegen der Armut des Klosters ‚Korennaja Wüste des Heiligen Nikolaus des Kriegers im Bezirk Belgorod‘ abzuschaffen und das wundertätige Bild in die Belogorodische Kathedrale der Dreifaltigkeitskirche zu übertragen, während die verbleibende Kirche des Heiligen Nikolaus des Wundertäters zur Pfarrkirche gemacht wird…“.

Vor der Revolution wurde jedoch jedes Jahr am 18. Mai das Ikone durch einen Kreuzweg nach Ustinka zurückgebracht und blieb dort bis zum 24. Mai, danach wurde es rechtzeitig zur späten Liturgie in die Kathedrale des Klosters nach Belgorod zurückgebracht.

Im Jahr 1808 wurde in Ustinka eine neue Steinkirche erbaut, aber nach der Revolution von 1917 wurde der Tempel zerstört, und an seiner Stelle entstand eine Schule.

Der Bau der neuen Kirche begann am 7. Juni 2007, und sie wurde am 26. Juli 2014 von Metropolit Ioann von Belgorod und Starooskol geweiht. Im Jahr 1995, als das Ikone des Nikolaus des Kriegers wiedergefunden wurde, wurden die Kreuzwege zum Fluss wieder aufgenommen. Jetzt führt der Kreuzweg von Belgorod zur Nikolauskirche in Ustinka und dann zur Quelle am Fluss.