Die Kirche des Heiligen Alexius, Metropolit von Moskau, die früher Teil des Christgeburtklosters war, befindet sich westlich der Christgeburtkirche. Die Vorhalle der Kirche des Heiligen Alexius mit Glockenturm und Heiligen Toren wurde 1701 unter der Äbtissin Anna errichtet.

Von der Westseite grenzte eine Uhrbude auf vier Holzsäulen an die Kirche, und von innen gab es zwei Holzvorhallen. Im Jahr 1732 wurde die baufällige Kirche, von der die Kuppel gefallen war, repariert. 1748 brannte die Kirche zusammen mit dem Inventar nieder, wurde aber bald wiederhergestellt. Wahrscheinlich wurde damals die Holzsäule für die Uhr durch einen Ziegelstein mit einem inneren Zugang ersetzt, die bis heute erhalten geblieben ist.

Die Alexeuskirche zeichnete sich nicht durch Reichtum an Inventar und Ikonostase aus, da die Gottesdienste hauptsächlich im Sommer stattfanden, wenn alles Notwendige aus der Christgeburtkirche gebracht wurde. Ende des 18. Jahrhunderts brannte die Kirche erneut, und die Glocken im Glockenturm zerbrachen oder schmolzen. Die beschädigte Glockenebene wurde abgerissen und ein höherer Glockenturm im klassischen Stil gebaut. Möglicherweise wurden damals auch die Fensterlaibungen im Stil des Naryschkin-Barock verputzt, deren Spuren an den Wänden sichtbar sind. Um 1800 wurde der Glockenturm fertiggestellt, und es wurden sechs Glocken, gegossen in der Moskauer Fabrik des Kaufmanns Strugovnikov, aufgezogen.

Im Jahr 1896 wurde mit dem Segen von Bischof Misail die baufällige Vorhalle abgerissen und an die Südwand der Kirche ein zweigeschossiges Ziegelgebäude angebaut, in dem seit 1898 eine Mädchenschule der Kirchengemeinde betrieben wurde. Die Schule wurde nach der Revolution geschlossen, und das Gebäude wurde beschlagnahmt. Später wurde auch die Vorhalle der Kirche geschlossen und die Glocken abgenommen. Während des Großen Vaterländischen Krieges brannte die Schule nieder, und der Glockenturm wurde durch Granatsplitter beschädigt.

In den Jahren 1947 und 1949 begann die Entwicklung eines Wiederherstellungsprojekts. Die Autoren des Projekts waren der Denkmalschutzinspektor M.V. Kaplinsky, der Hauptingenieur Lisitsin und der Planer Gusаров. Das Projekt sah den Abriss des Glockenturms aus dem 19. Jahrhundert und die Wiederherstellung der Kirche in der Form vor, die sie nach Meinung von Kaplinsky zu Beginn des 18. Jahrhunderts hatte, obwohl es dafür keine dokumentarischen Beweise gab.

Aufgrund von Geldmangel wurde das Projekt nicht vollständig umgesetzt. Die Restauratoren rissen den Glockenturm ab und entfernten den Putz an den Heiligen Toren, wodurch Spuren der Fensterlaibungen aus dem 18. Jahrhundert freigelegt wurden. Die teilweise restaurierte Kirche gelangte in die Hände zufälliger Nutzer, was zu weiteren Verlusten führte. Der zweite Stock der Apsis wurde abgerissen und durch eine Holzscheune ersetzt. In diesem Zustand hat die Kirche bis heute überlebt.