Die erste Kirche im Dorf Pektubayevo im Jaranskij Ujesd der Wjatka-Gouvernement, aus Holz und mit einem Altar, wurde 1734 erbaut und zu Ehren der Geburt Christi geweiht. Der steinerne Tempel wurde 1820 mit Mitteln der Gemeindemitglieder unter dem Segen des Bischofs von Wjatka, Amvrosij Vyshizerov, errichtet. Bis in die 70er Jahre des 19. Jahrhunderts wurden in der Kirche Altäre zu Ehren der Geburt Christi (20. Oktober 1862), des Propheten Elia (wirkte seit den 1820er Jahren) und der Schutzmantel der Heiligen Gottesmutter (9. Oktober 1863) geweiht. Im Jahr 1915 gehörten zur Kirche Kapellen zu Ehren der Geburt der Heiligen Gottesmutter, der Herabkunft des Heiligen Geistes auf die Apostel, des heiligen Nikolaus des Wundertäters, der Märtyrer Flora und Lavra, des großen Märtyrers Georgs des Siegreichen und der gleichapostolischen Konstantin und Helena. Der Personalbestand der Kirche umfasste 3 Priester, einen Diakon und 3 Psalmodisten. In der Gemeinde befanden sich eine kirchliche Schule in Pektubayevo, eine Schule des Ministeriums für Bildung in Kuglanur und 7 Landeschulen in den umliegenden Dörfern.

In der Sowjetzeit unterstützten das Klerus und die Gläubigen der Kirche keine Erneuerungsbewegung, in den 1930er Jahren gehörten sie zum Mariischen Vikariat der Nischni-Nowgorod-Eparchie. Der Protopriester Nikolai Titovich Ignatiev, der über 40 Jahre in Pektubayevo diente, versuchte, seine Gemeinde vor Irrtümern zu bewahren. Er wurde am 26. April 1938 verhaftet und wegen der Teilnahme an einer konterrevolutionären Organisation, antikollektivistischen Agitation und der Verbreitung von Gerüchten über den baldigen Sturz der sowjetischen Macht angeklagt. Am 25. September 1938 wurde er in einer Sitzung der NKWD-Troika für die MARSRS zu einer Hinrichtung verurteilt, die am 27. September um 20 Uhr vollstreckt wurde.

Der Diakon Michail Nikolajewitsch Favorski, der 1922 ordiniert wurde, verteidigte ebenfalls die Gemeinde, indem er die Gläubigen überzeugte, gegen die Abnahme der Glocken im Jahr 1935 und die Schließung der Kirche im Jahr 1936 zu protestieren. Am 31. Oktober 1938 wurde er verhaftet und ins Gefängnis von Joschkar-Ola gebracht. Bei den Verhören und Konfrontationen wies er die falschen Anschuldigungen zurück. Doch am 26. Januar 1939 wurde er zu 10 Jahren Haft verurteilt, und sein weiteres Schicksal ist unbekannt.

Die Pektubayevo-Kirche wurde am 13. September 1936 geschlossen und als Klub genutzt, später als Dorfhaus der Kultur und Bibliothek. Die Gemeinde in Pektubayevo wurde 2004 wiederhergestellt, und im selben Jahr fand der erste Gottesdienst statt. Im Jahr 2008 wurde das Gebäude der Kirche vollständig an die Gläubigen zurückgegeben, und seitdem wird es renoviert. Ein wichtiges Ereignis war die vollständige Erneuerung des Daches vor vier Jahren.