Die ersten Holztempel an der Stelle der heutigen Christgeburtskirche entstanden im 17. Jahrhundert, als hier das Dorf Kowrowo lag, das dem Makariowo-Unzhenski-Kloster gehörte. 1625 wurde auf das Geheiß des Patriarchen von Moskau und ganz Russland, Filaret, das alte Gebäude der Dreifaltigkeitskirche mit einer Kapelle zu Ehren der heiligen Märtyrer Flora und Laurus von Klosterleiter Igumen Zosima nach Kowrowo verlegt. Zu Beginn des 18. Jahrhunderts war der Holztempel baufällig, und am 11. Oktober 1715 begann der Bau eines neuen. Innerhalb von zwei Jahren wurde der Tempel errichtet und am 14. Februar 1717 von dem Klosterleiter Igumen Leontij Pawlow geweiht. Die Hauptheiligkeit wurde das Tichwiner Ikone der Gottesmutter, gemalt von dem bekannten russischen Ikonenmaler Kornilij, im weltlichen Leben Kirill Ulanow. Der neue Tempel wurde zu Ehren dieses Ikone geweiht.

Nach der Revolution von 1917 erhielt die „alte Kathedrale“ eine besondere Rolle im Leben der Region Makariowo. Zu Beginn der 1920er Jahre übergaben die Behörden die Tichwiner und Alexander-Newski-Kathedrale den Renovatoren, und 1929 wurde das Makariowo-Unzhenski-Kloster geschlossen. In den 1930er Jahren blieb die Christgeburtskirche der einzige aktive Tempel in Makariowo. 1937 wurde der letzte Tempelleiter, Priester Alexander Wasiljewitsch Wolodin, verhaftet und erschossen, wonach der Tempel geschlossen wurde. 1945, nach zahlreichen Bitten der Bewohner von Makariowo, wurde der Tempel den Gläubigen zurückgegeben, und im September desselben Jahres wurden die Gottesdienste wieder aufgenommen. So wurde er zur einzigen aktiven Kirche im Makariowo-Distrikt. Von 1992 bis zur Übergabe im Jahr 1994 befanden sich im Tempel die Reliquien des heiligen Makari von Unzha, des Wundertäters.